在諸葛亮上臺之初，不僅面臨著缺乏幫手的局面，同時蜀漢內外也是憂患重重，外部曹魏勢大，遣使勸降，孫權雖談，但依然不穩，內部南方叛亂，雍闓、孟獲作亂。
面對這個局面，諸葛亮內修政治，外部連孫抗曹，南下平定叛亂。
【掌控大權】
在劉備死後，諸葛亮成為了蜀漢實際上的統治者。他不僅領益州牧，政事上的大事務，劉禪也都依賴於諸葛亮，由諸葛亮決定。
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據《魏略》記載，初備以諸葛亮為太子太傅，及禪立，以亮為丞相，委以諸事，謂亮曰：“政由葛氏，祭則寡人。”亮亦以禪未閒於政，遂總內外。
【曹魏勸降】
劉備死後，黃初四年（）曹魏認為蜀漢已經無人，於是文帝曹丕派遣虎牙將軍鮮于輔到蜀漢勸降，同時曹魏大臣們也紛紛給諸葛亮寫信勸降。
據《諸葛亮集》記載，同年，司徒~華歆、司空王朗、尚書令陳群、太史令許芝以及謁者僕射諸葛璋分別致書與蜀相諸葛亮，向其陳天命人事，希望蜀漢能舉國稱藩，但徒勞無功。
諸葛亮沒有回書，而是寫了一篇正議：“昔日西楚霸王項羽，不以仁德對待百姓，即使力量強大，有帝王的威勢，最終還是身敗名裂，成為千古遺恨。如今魏國不吸取項羽滅亡的教訓，反而去追求效仿，即使曹操有幸不死，他的後代子孫也必然要滅亡的。那些寫書勸降我的人，他們一把年紀了行事卻順從賊子之意，就像當年陳崇、孫竦稱讚王莽篡漢一樣，討好盜賊，卻還是被盜賊逼迫而死！光武帝創業時，率領幾千人就在昆陽郊外一舉擊潰敵軍四十萬。足見以正道伐淫邪，勝敗不在人數。曹操詭詐，糾集十萬人來戰先帝，妄圖救張郃於陽平，卻只落得狼狽逃竄，不但辱沒了精銳之師，還丟掉了漢中，此時他才知道，國家是不能隨便竊取的，沒及他退軍回到家，就已染病身亡。曹丕驕奢淫逸，篡奪帝位。即便你們幾個像張儀、蘇秦那麼能詭辯，得天花亂墜、滔滔不絕，也不可能詆譭堯、舜，白白浪費筆墨而已！正人君子絕不會這麼做。《軍誡》中：‘如果一萬名士卒，抱著必死的決心，那就可以天下無敵了’昔日軒轅皇帝率領幾萬士卒，還能擊敗四位帝王，平定天下。何況我們有幾十萬兵馬，是在替天行道，討伐有罪的人，那誰還能夠與我們匹敵呢！”
【內外對策】
在劉備死後，蜀漢面臨的局面很是艱難，核心人物已經大多逝去，曹魏甚至直接欺負蜀漢無人，要求其劉禪、諸葛亮投降。而蜀漢的國力經過襄樊之戰、三郡之變以及夷陵之戰已經大損，南郡等三郡被江東奪取，上庸等地被曹魏佔據，和孫權、曹丕之間的關係也談不上好，南方的叛亂更是還有著盟友孫權的影子。
無人、無兵、國力不足、內部有亂、缺乏盟友，這就是諸葛亮上臺之初面臨的局面。
面對曹魏的欺壓，諸葛亮只能以以大義駁斥，然而幸運的是當時的魏帝曹丕一門心思收拾孫權，對於蜀漢沒有進一步的動作，給了諸葛亮緩衝的時間。這和《三國演義》中記載完全不一樣的，在正史中並沒有五路大軍伐蜀的事情，當時曹丕和孫權已經鬧翻了，孫權不可能還未曹丕效力的，而孟獲並不是南中叛亂的主謀，雍闓才是。羅貫中後來寫諸葛亮罵死王朗一事也應該此時王朗等人勸降有關係，正史上王朗和諸葛亮之間聯絡並不多。
對於盟友孫權的重要性，在經過諸多事情之後，諸葛亮有著更為深刻的認識，他很清楚荊州已經要不回來，而要對付曹魏，孫權是不可缺少的，所以諸葛亮對於孫權放的態度很低，也很真誠，而孫權也不傻，雙方和則兩利。
面對南方的叛亂，諸葛亮並沒有第一時間給以回應，首先是蜀漢經過一系列的打擊之後，國力大損，而劉備也剛剛去世，事物繁多，諸葛亮無法集中精力，集中力量平定叛亂；其次蜀漢當時連續作戰，兵力受損較大，不宜再戰；再次南方雍闓等人後面有著孫權的影子，所以諸葛亮要先搞定東吳，斷絕雍闓可能的外援；南中整體叛亂，事情很大，而蜀漢也輸不起了，所以諸葛亮要先等等，把握大了之後再動手。
經過兩年的修養生息後，蜀漢糧草補給已經充足，孫權也已經被搞定，諸葛亮果斷出兵了，一戰功成，平定了南中四郡的叛亂。
歷史上南中四郡一直是蜀漢集團控制的一個薄弱地帶，在劉備早期入益州時，就沒有發兵過南中四郡，這一帶早期就只是在表面上表示了對劉備的臣服，所以蜀漢對這裡的控制一直不牢靠，而且這一帶少數民族很多，漢族的優勢不大，所以很容易出現動~亂。
在諸葛亮初步平定叛亂後，南中一帶的叛亂依然不少，最後蜀漢不得不留馬忠、張嶷等人平亂。歷史上yn縣在漢朝已經被設立，諸葛亮平定南中後，進一步建立了yn郡，後來yn逐漸被建為省。
諸葛亮在平定南中後，看到當地的少數民族兇悍，就以他們為基礎，建立了無當飛軍。諸葛亮為了避免恢復和平後，那些剽悍的戰士便陷於失業，於是將他們整合起來，就此實施了一箭雙鵰的有利政策，就是徵召少數民族戰士加入蜀國政府軍，而經費問題，就由當地地方豪強解決。
無當飛軍在歷史上夷漢部曲都是主力。他們皆身披鐵甲，能翻山越嶺，善於使用弓弩和毒箭，尤其精於防守作戰，在後來諸葛亮北伐時有著很出色的表現，蜀國後來委任治軍嚴謹的魏國降將，王平為該軍團第一任統帥。
就此，諸葛亮在劉備死後兩三年內就已經大體上恢復了蜀漢的和平，並且重新與孫權達成了同盟，之後諸葛亮暫時蟄伏於南方，積蓄力量，等待著時機的來臨。