袁世凱不得不緊急召集在京所有人召開會議，商討如何面對宋教仁遇刺一案，而宋教仁遇刺身亡的訊息又不得不讓人聯想到王永安遇刺案，民國初建，陸軍次長和下一任內閣總理便接連遇刺，充分說明了政治漩渦有多麼可怕。
袁世凱在會議上大聲疾呼：“我們一定要抓住兇手，抓住幕後黑手，抓住那些破壞共和的人！”
王永安心中玩味起來，這宋教仁遇刺似乎時間上來的早了一些，也許是因為自己這支小蝴蝶的原因，讓很多歷史上的事件或提前或延後發生了。但歷史上的著名事件卻又陸陸續續地產生，並沒有因為自己的出現而消失，這不得不讓王永安感慨歷史的慣性是多麼的強大，滄海一粟的小人物終究只能影響卻無法阻止歷史的發生。
與會眾人中自然王永安最有發言權，畢竟他也遭遇了行刺一事，只是宋教仁身亡，而王永安安然無恙罷了，袁世凱希望王永安能夠說什麼，最後王永安不得不表態說：“宋教仁遇刺發生在滬市，我希望儘快成立專案調查組前往滬市進行調查，在調查組找到證據之前，任何隨意作出結論的人，都有轉移公眾視線的嫌疑。”
袁世凱拍案叫絕，隨後立即成立專案調查組前往滬市進行調查，而王永安此時也為了下一任內閣而奔走，第一任內閣總理唐紹儀隨後宣佈辭職，內閣十二部也隨之解散了。
宋教仁遇刺與唐紹儀辭職沒有因果關係，卻又前後聯絡，因為宋教仁的身份是民黨黨魁，而在前一個月的國會選舉中，民黨大獲全勝，無論是參議院還是眾議院，民黨票數均過半，按照國際慣例來說，國會選舉中獲勝的黨派魁首自動出任內閣總理，並有權重新組建內閣。而唐紹儀似乎也有心成就宋教仁，於是接受了國會的辭職申請，等待宋教仁從滬市來到京師之後，即刻辭職移交內閣總理權力。
宋教仁固然沒有孫逸仙能出牛，但是宋教仁的人脈要遠遠超過孫逸仙，在民黨黨內地位極高，由於孫逸仙在南京臨時政府中的政治經驗的不足和犯下不少戰略性的錯誤，導致南京臨時政府分道揚鑣，宋教仁車技重組民黨，並逼走了孫逸仙。這也是孫逸仙最終接受南北和談，並接受接受袁世凱任命為鐵路總局局長的原因之一，畢竟他成為了一個光桿司令，除了陳其美和黃興沒有人再支援他。
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宋教仁聯合了民黨保守派、復興社等眾多派系，被選為民黨總裁。在孫逸仙醉心於十年十萬公里鐵路的時候，宋教仁默默地發展黨派成員，並最終在國會選舉中一舉獲勝，震驚了天下。而這個訊息卻被同時發生的王永安遇刺案淹沒，直到得意洋洋的宋教仁前些時日在滬市舉行的民黨大會上公開且明確地撇開孫孫逸仙發明的五權憲法而大講他自己三權分立的憲政設想：“討論憲法，行政、立法、司法三權應如何分配，中央與地方之關係及許可權應如何規定，是皆當依法理，據事實，以極細密心思研究者”。
如果說宋教仁僅僅反對孫逸仙也就罷了，隨後他以更加激烈言辭全盤否定袁世凱政府當局的內政外交，認為只有民黨方面出面組織的議會政黨責任內閣，才是救治“不良政府”的醫生。
按照英法慣例來說，總統是虛職，國會最大有權組閣，而按照美國的辦法，國會選舉出來的便是總統，宋教仁甚至可以直接踢走袁世凱，只是宋教仁得意洋洋地認為畢竟袁世凱為推翻滿清立下赫赫功勞，就讓他做虛職總統吧。但是對於內閣十二部，宋教仁很不滿意，他批評如今的內閣十二部很多人都是尸位素餐不謀其政，而有一些政府人員則只會貪汙受賄不做實事，因此他要堅定地進行組閣，重新任命內閣十二部和四總局人選。
實際上宋教仁是在向所有人宣佈，接下來內閣改組，你們必須向我臣服，快點對我表示效忠吧，我已經張開胸懷了……
可如今的內閣十二部人選是北洋、江北和民黨三方博弈的後果，當初為了能夠推翻滿清建立中華民國，三方都做出了不小的讓步，經過兩年的反覆談判，如今宋教仁還沒有擔任內閣總理，居然全盤否定了當初的結構。
後世有一句話叫做不作死就不會死，宋教仁正應了那句話。
他犯下了諸多大錯，首先他不應該否定民黨建立者孫逸仙的建黨綱領，這相當於民黨分裂了，雖然孫逸仙是一個嘴炮領袖，但畢竟是孫逸仙建立了民黨，對黨派有著極大的貢獻，宋教仁出於黨爭的原因徹底否定孫逸仙，否定了很多人心中的偶像，得罪了不少民黨中人。
其次，宋教仁誤以為中國國會與外國國會相同，只要民黨取得了國會的領導權，他便是內閣總理了，而唐紹儀為了遏制袁世凱的獨裁選擇辭職也給了他一個錯誤的訊號，讓他飄飄然了起來。但此時的中國尚且沒有確定國家實行總統制還是總理制，結果宋教仁便認為中國必須實行總理制，甚至提出徹底改選內閣的決定。
最後，宋教仁完全不懂得政治鬥爭中的縱橫關係，在還沒有擔任內閣總理之前，宋教仁便大言不慚且大談天下改革，完全沒有拉攏另一派系民黨和江北系來對抗強大的北洋系的想法，犯了政治上的一個大錯。
尤其是民黨獲勝之後，完全沒有理會江北系的立場和態度，甚至於宋教仁認為王永安、張謇、陳兆棠等江北系官員會主動向他靠近，只可惜江北系只認實力不認他這個未來內閣總理，因此宋教仁還批評王永安說：“江北官吏干涉軍隊過多，勢必會影響國家穩定，國家不穩定談何崛起。”
王永安生了病沒有理會宋教仁，卻讓宋教仁以為王永安怕了他，氣焰更加囂張，而報紙開始對宋教仁吹捧起來，認為宋教仁組閣必定能夠開創中華民國之璀璨明天云云，完全忽略了袁世凱的態度，以為袁世凱真是一個傀儡總統了。