而此刻的旭日帝國也露出了尖銳的獠牙。天皇芳朗唯一遺憾的就是沒有將華國登陸部隊完全騙進陷阱中，不過盟軍和蘇聯既然已經中招。看起來天命使然，旭日帝國統治世界的命運難以改變。只要幹掉了這批聯軍，帝國就還有再次崛起的機會！
當盟軍和蘇聯的大軍長驅直入，在幾乎未遇到多少抵抗的情況下攻入東京市核心區內。不過正當部隊眼看就要打進旭日帝國的大本營東京的皇宮時，意外還是出現了。原本防禦稀疏的城市一下子變了樣，大量自動防禦武器從地下冒了出來封鎖了城市中所有主要幹道。失蹤的旭日帝國主力部隊從城內隱藏的地下掩體處不斷的湧上街道，配合固定防禦武器對城內的兩**隊進行全面圍剿。
地面上無數的脈衝導彈從城市各處飛向天空中兩國的戰機群，一瞬間就摧毀了一大半部隊。由於埋伏太過突然導致飛行員還沒搞清楚狀況就去見了上帝。近千架各型戰機彷彿流星一般不斷的從空中墜落。除了一些反應較快的制空戰機及時逃脫，其它空中單位均遭到了沉重打擊！盟軍的冷凍直升機與蘇聯的雙刃直升機群更是幾乎全軍覆沒。而天空中那些裝甲極厚防禦力暴強的蘇軍基洛夫汽艇此時也被打的搖搖欲墜，看那樣子恐怕也堅持不了多久了。
在取得區域性制空權後，天空中一千多架天狗戰機掩護著數百架打擊者v/直升機群對城內的兩國裝甲部隊進行瘋狂獵殺，大量海嘯坦克與鬼王機甲掩護著無數步兵部隊從四面八方將城內的聯軍分割包圍。一時間三百多萬大軍均被旭日帝國包圍在城中陷入了進退維谷的窘境。
雪上加霜的是在這些旭日帝**隊中，居然出現了好幾種從來沒有見過的新兵種。而這些新敵人所擁有的詭異作戰能力，更是將城內兩國聯軍逼入絕望。特別是一種在天空中飛行的巨大要塞更是揮之不去的噩夢。雖然戰場上一共只有臺，但其強大的破壞力實在讓人恐懼，只需一擊就可以燒燬面前直線很長一段距離內的一切物體，並能引起地表震動，地面上大量的坦克戰車就這樣被瘋狂屠殺。最讓人頭疼的是這種空中堡壘似乎還有自我修復功能，使得兩國聯合組織的多次對空獵殺作戰均無果而終，反倒是白白損失了大量防空戰車和充當誘餌的地面部隊。在缺乏制空權的前提下，根本無法將其一舉擊殺。
而這種天空堡壘正是天使集團最新發明的戰爭利器—超級要塞，要塞安裝的帝國最先進的智慧控制裝置—giga十億單元自最佳化核心，這種裝置先進之處就是可以透過二級指令處理中心協調控制要塞的所有重要系統。而其裝備的武器也是帝國有史以來最為強大的存在，不論是在何種模式下都能造成極大的破壞。
特別是空中模式擁有的神之鼻息－1型離子光束炮，簡直就是現代戰爭史上的傑作。這種巨大的光束炮被安在空中形態的嘴中，可發射一道破壞力極大的電離光束，能夠輕易摧毀直線距離上的一切物體。而其特有的兩段式變身更使其在海上擁有無與倫比的戰鬥力。要塞唯一的缺恐怕就是空中模式無法對空。
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這種武器雖然厲害，可還沒有讓人感到不可戰勝。只不過真正讓城內兩國聯軍恐懼的是一種能夠在天空中飛行的旭日帝國步兵，這些自稱火箭天使的武裝悍婦，不但可以使用光子火箭發射巢對地面目標進行火力打擊，而且其裝備的某種古怪的癱瘓光鞭極其邪惡，一旦被其纏住任何裝備都會難以動彈。在這些空中催命鬼的幫助下，聯軍根本就沒有一絲一毫的獲勝機會。唯一值得慶幸的是擁有防空部隊保護的聯軍暫時還不必擔心這些傢伙的正面襲擊。但是在多兵種聯合作戰的大背景下，想要一直堅持下去不被突破也不是一件容易的事情。
而這些還不是噩夢的結束，在前期襲擊中殘存的直升機部隊很快就遭到了一群手拿弓箭少女的圍攻，他們裝備的特殊弓箭發射的東西居然可以輕易穿透直升機厚重的裝甲，在這些少女密集的箭雨殘存的直升機部隊很快被消滅殆盡。而這些少女在完成這一壯舉後，很快又將目標指向了那些落單的聯軍步兵身上，他們在與坦克殺手和部分忍者的密切配合下大殺特殺，殲滅了城內許多落單的聯軍分隊。
城內的蘇軍部隊在這場混戰中所有重武器幾乎損失殆盡，人員傷亡超過三分之二。能夠殺出重圍運氣的成分佔了很大一部分。而這些能夠衝出埋伏的蘇軍部隊很大一部分是憑藉著天空中那些基洛夫飛艇墜毀時大爆炸所引起的混亂強行突圍出來的。
相對而言盟軍的撤退反而愜意了許多，它們憑藉著幻影坦克的裂縫發生器神不知鬼不覺的將散落在城市周圍的部隊集結了起來。隨後利用雅典娜加農炮的遠端攻擊力和變態的神盾防禦系統。成功的突破了一道又一道封鎖線。可惜的是雖然重武器損失不大，但為了對付天上的麻煩防空戰車卻在掩護突圍時消耗殆盡。
為了幫助城內兩國部隊從陷阱中儘快脫身，在橫濱的聯軍部隊動用了所有遠端火力瘋狂的向東京城內傾瀉著怒火，無數遠端炮彈，巡航導彈密集的砸向城內旭日帝國的主要軍事基地。搞的後來旭日帝國不得不啟動奈米蟲群屏障保護自己的基地安全了。只不過那東西也不是萬能的，空軍基地的徹底毀滅就是一個最好的例子。
誰讓他們在遭到盟軍超級武器—質子對撞炮攻擊時，罩上奈米蟲群屏障.........。結果本來也就能把機場摧毀的攻擊，演變成了毀滅整個空軍基地的大爆炸........！不但停放在裡面的大量神風無人機全都了報銷，順便還幹掉了不少回來檢修的旭日帝國空軍戰機。巨大的損失搞得旭日帝國後續的圍殲計劃更加難以有效實施了。
經過了初期的混亂彷徨後，兩國聯軍在付出了極大傷亡後終於在城中站穩了腳跟並控制了一部分城區。只是和初期進城時的三百多萬大軍相比，剩下的部隊已經不到當初進城的一半軍力，更糟糕的是受傷的傷員數量就佔了整整三分之一。要不是盟軍擁有超時空傳送儀能夠進行短距離傳送，恐怕其中大多數重傷者很難活著離開這座城市了。
不過旭日帝國那頭也不怎麼好受，這次包圍本來十拿九穩。可是華國突然對東京外圍城市的攻擊打亂了初期的部署，導致隱蔽在外圍城市的許多部隊被華**隊纏住。雖然城內的戰鬥取得的效果還是很輝煌的，可是圍殲戰打成了現在的拉鋸戰這就很失敗了。
而橫濱方向意外的炮火襲擊讓城內的旭日帝國追擊部隊很是受傷。受到無線電靜默的影響，導致了橫濱被完全佔領的訊息情報部門一直沒有接到。所以在沒有防備情況下，遭到了突然的火力急襲，結果這場計劃以外的攻擊幾乎摧毀了旭日帝國所有的裝甲部隊。甚至連天空中的那三臺超級要塞也被密集的巡航導彈給幹掉了兩臺。最糟糕的是本來用於最後一擊的神風無人機群，由於空軍基地莫名其妙的徹底毀滅而宣告破產。
地面上的步兵部隊的損失那就更嚴重了，有幾個獨立師團在密集的炮擊中乾脆就被除名了。那些炮彈簡直變態到了極，居然一枚炮彈裡面還有幾百枚炸彈，而炮彈中裝的還全是鋼珠，不過最可恨的是那東西居然還有跟蹤功能........！在這種突然的覆蓋性的打擊下想不死都困難。不過更麻煩的還在後面，華國攻擊部隊不知道用了什麼方法，居然只用了不到6個時就擺平了外圍城市隱藏的三百多萬大軍，這簡直太讓人難以置信了。
他們並不知道，華國這80多萬部隊中幾乎一大半都是參加過上海會戰的老兵，而其中大多數還都是裝備更加先進武器的次元政府國防軍成員。真正的**的軍隊只佔了極少的一部分，大概也就不到十幾萬人吧。不過這些都不足以如此迅速的解決那三百多萬旭日帝國大軍。真正幹掉他們的是秘密參戰的十五支影子部隊特別行動組和三個戰鬥力極強機械兵團。解決了城外的麻煩後，華**隊迅速的突破了東京外圍的封鎖線，很快就與殘存的聯軍完成了會合。
隨後三方部隊經過簡單整備後開始再次向旭日帝國的核心區域天皇宮前進。在華國神罰戰機的配合下，輕易的消滅了對方的所有空軍部隊。隨後更是徹底摧毀了宮殿四周的三座重要軍事基地，並成功突破了皇宮周圍設下的三道堅固防線。雖然部隊前進過程中也遭到了對方超級武器超能波毀滅裝置的數次襲擊，但在蘇軍動用鐵幕裝置保護下，成功的抵擋住了巨型超能波的毀滅性打擊。而那些裝置在發射之後，就已經不可避免的暴漏了自己的位置。雖然對方有奈米屏障的保護，但是結果依然是被無數鑽地飛彈炸成了碎片。連帶著那些奈米蜂箱也被一並處理了。
在0秒真男人的無敵光環保護下聯軍裝甲部隊成功的完成對皇宮的合圍作戰，只不過部隊在對帝國最後的據發動總攻時，卻遭到了前所未有的激烈抵抗。旭日帝國最為精銳的近衛師團強大的戰鬥力讓進攻部隊損失慘重。而不斷從地下冒出的仿生人部隊更是給進攻部隊造成了極大的阻力。為了儘快拿下這裡，幹掉該死的天皇芳朗同學，聯軍的各種隱藏手段紛紛亮了出來。
蘇軍指揮官尼克萊.莫斯文憑藉自己的許可權，將太空那破爛衛星全都傾瀉到了皇宮周圍的密集防禦上造成了守軍極大的損失。為了加強破壞效果，這傢伙隨後又將已經報廢多年的禮炮和聯盟空間站都給砸了下來！蘇軍廢物利用的作戰手段實在讓人歎為觀止，值得我們認真學習。
只不過和盟軍的指揮官華倫.富勒的手段比起來，還是有些巫見大巫了。因為這傢伙居然先使用了大範圍冰凍技術，將皇宮周圍的幾座極度堅固要塞凍住，隨後又使用傳送技術，把各種型號的定時炸彈部署到周圍。結果堅固的要塞就這樣被陰掉了陰掉了......！戰局一下子變得對聯軍有利了起來，不過從遠方突然趕來的旭日帝國超級要塞又再一次將聯軍的地面攻勢打的粉碎。在數百名火箭天使的簇擁下，僅存的超級要塞不斷的使用破壞力驚人的電離光束，造成了三國聯軍地面部隊極大的傷亡。雙方的戰鬥愈演愈烈，傷亡也在不斷增加........。