在聯軍攻下長安之後的很長一段時間內，西涼軍這些將領們的關係都是居於盟友和隊友之間，他們是盟友吧，他們又認為都是自己人，他們是隊友吧，他們實質上又是結盟關係。
李傕、郭汜、樊稠、張濟等人都認為自己歸屬於西涼軍，但他們也都認為自己的實力和地位不比別人抵，每個人都覺得大家以前都是校尉，一起為董太師報了仇，功勞也差不多，所以我憑什麼要聽你的，哥有兵有糧有地盤怕你啊！
結果就是董卓、牛輔死去以後，西涼軍雖然名義上還是一個整體，但實際已經四分五裂，其中李傕、郭汜、樊稠三人實力最強，所以他們聯手控制了長安，掌控了朝廷，張濟、段煨等人也都各領軍隊，控制一方。
可俗話得好，一山難容二虎。以前李傕是西涼軍中唯一一位開府的將領，他實力最強可以壓的過郭汜和樊稠，再加上朝廷裡漢獻帝和三公還有一定影響力（因為李郭等人原來的地位太低，沒什麼人可用，朝廷得以保留了一部分力量，但隨著時間變長，朝廷的影響力愈來愈弱），所以一開始矛盾還可以調和。但在郭汜和樊稠也開府以後，三人的差距就沒有那麼大了，那時候朝廷也已經無法影響西涼的大佬們了，隨著三人在軍事、政治、經濟方面的一系列衝突，矛盾一觸即發。
李傕首先開始不滿樊稠，不同於跟他長期作戰的好哥們郭汜，樊稠是在進軍長安的中途才加入西涼聯軍的，但架不住樊稠的實力強，最終張濟都被擠出了長安他都留了下來，雖然地位不如李郭二人，但總體實力還真差不到哪裡去。
李傕對樊稠的不滿在對馬騰和韓遂的戰爭後進一步上升。樊稠在進攻馬騰、韓遂的時侯，李傕的侄兒李利作戰不力，樊稠便斥責他：“人家要來砍你叔父的頭，你還膽敢如此鬆懈，難道我就不能斬了你嗎！”馬騰、韓遂退走涼州時，樊稠率軍追擊。韓遂派人對樊稠：“天下之事反覆無常難以預料，你我同鄉，今天雖有些摩擦，恐怕還會走到一起的，想和你談一談。”二人於是並馬拉著手臂，笑了很久。
在班師回朝後，李利告訴李傕：“樊稠、韓遂二人馬並馬肩並肩不知道著什麼開懷大笑，關係看起來很親密的樣子。”雖然李傕後來還是同意了給樊稠開府，但他心裡沒有芥蒂是不可能的。
郭汜和樊稠開府以後，也可以參與選拔舉薦官吏。李、郭、樊都要朝廷任用自己推舉的人，一旦不隨心意，便大加威脅，那些主管的官員們沒有辦法，最後只能按照李、郭、樊的順序依次任用官吏，至於三公所推舉的人根本就連機會都沒有。
李郭等人在長安城乃至於整個關中地區的胡作非為，破壞了這一帶的基本秩序，使得了整個長安都亂成一團、盜賊橫行，甚至白日搶劫的事情都頻頻發生。到最後他們沒有辦法，於是乾脆將長安一分為三，三人各守其地，但就算如此仍然沒有阻止情況繼續惡化，他們的那些親朋好友、親信黨羽們依然我行我素，橫行不法，侵害百姓。
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弄到最後長安城內或者整個關中地區都物價飛漲，穀米一斛達到了五十萬錢，豆麥二十萬，就算當年董卓濫發錢的時候，買一石谷（即一斛）也不過花數萬錢，此時才過去五六年而已。堂堂帝國首都，天子所在，結果卻是人以人為食，白骨遍地，這下漢獻帝也看不下去了，開放太倉救濟百姓。
但李傕、郭汜、樊稠因為軍隊糧食不夠，雖然賈詡百般勸阻但他們依然決定侵奪獻帝拿來賑災的錢財，可就算是這樣他們的軍糧還是不夠，於是他們乾脆放縱軍隊向老百姓搶奪，其結果是人為的火上澆油，造成了更嚴重的饑荒，關中一帶的老百姓們不得已紛紛逃離家園。
這個時候樊稠也受不了了，他也受夠了當三。興平二年（195）樊稠決定離開長安，李蒙等人也支援，他們準備率領自己的部隊東出函谷關。但樊稠在臨走之前，認為他把他在長安的地盤讓給了李傕，於是他要求李傕給他增加部隊作為補償。可是李傕既想要樊稠的地盤，也不想給他軍隊，不僅如此，他還想要樊稠的部隊，乃至樊稠的性命。
樊稠作戰勇猛而且得到部屬擁戴，正面對決的話風險太高，於是李傕便設宴邀請樊稠、李蒙過來參加會議討論他們準備離開的這些事情，樊稠個人覺得自己都要走了，就沒有想到李傕還會有這些歪心思，他大大咧咧地便參加了這個宴會，然後他一去不復返。在會上李傕趁著樊稠喝醉，命自己的外甥騎都尉胡封用杖將其擊殺（也有記載是胡封刺死了樊稠），李蒙也被殺死。隨後，李傕吞併了樊稠、李蒙的部屬。
這一下李傕就太不地道了，大家都是西涼軍同僚，一起扛過槍,抽過煙（這個沒有）,喝過酒,打過仗的好兄弟。就算你在為董太師報仇的時候是領頭人，功勞最大，但樊稠、李蒙的功勞也不啊！樊稠、李蒙只是想離開長安問你要軍隊，他們又不是準備要你的性命，你不想給他們部隊的話就不給唄！怎麼可以下黑手呢？這一下李傕實質上就把馬蜂窩給捅了，有了李傕、樊稠的先例，西涼軍的將領們都開始互相忌憚起來。
在李傕沒有殺掉樊稠之前，儘管遇到了很多困難可西涼軍至少還保持著一個整體，各個將領們雖然都有著很大的自主權，但他們依然承認李傕的領頭羊的地位，在不損害他們自己利益的前提下，李傕仍然可以調動他們，這一就算是郭汜、樊稠也不例外。但在李傕殺死樊稠之後，他實際上是開啟了一個潘多拉魔盒，毀掉了西涼軍用來僅以維繫的那一絲信任，此後西涼軍再也沒有辦法作為一個整體而存在。李傕喪失了作為一個領頭羊的權威，西涼軍的其他將領再也不聽他的調遣，西涼軍的將領之間也開始相互不信任起來，最終他們互相殘殺，將董卓一手帶起來的西涼軍推向了毀滅的道路。