接下來，夢璃告訴眾人她要留任幻瞑界擔任族長，不能和天河等人回到人間，天河雖然希望夢璃留下來，但她已做了決定，不會更改，隨後夢璃請天河將離香草香囊交給養父母，也將帝女翡翠送給天河留作紀念。
最後天河與夢裡約定希望能在19年後崑崙山巔相見，對此夢璃只是不語。
在看到夢璃離開後，天河與菱紗感觸極深，而紫英也明白了其中的無奈。
望著水靈珠，決定不耽於感傷的想要將水靈珠交給月牙村村長，不料，等到他們前去到月牙村的時候，已經發現所有人都已離開月牙村了。
見到此景，紫英不由得感慨：瓊華派所有人身在崑崙，雖受人敬仰，卻無法澤被山腳下的百姓，如此大過，也枉被稱為劍仙。
於此同時雲天河想要繼續去尋找玄霄，但韓菱紗卻不讓他去，見二人爭吵不休，慕容紫英便提議去清風澗找青陽和重光兩位長老。
而云天河則是生氣兩位長老眼中只有玄霄，不顧韓菱紗的生死，明明知道望舒之事，卻從未言明。
但紫英所言或許他們有救菱紗的法子，去試一試也好，聽到這裡雲天河也是同意了。
但不料，等到眾人前去後才發現重光已陽壽耗盡而死，並且青陽也即將死去，最後青陽告知了眾人宗煉另留了手記，或有記載阻止使用雙劍繼而瓊華飛昇失敗，避免更大的危機。
於是天河等三人告別青陽長老，回到青鸞峰搜尋手記找出辦法，經過紫英查詢思考，發覺要阻止瓊華飛昇救下菱紗以及更多的人，可選的路太難。
而天河依然想盡辦法要阻止玄霄救菱紗，但等到眾人飛至因飛昇而冰封的瓊華後，卻發現整個瓊華已然如同煉獄一般，弟子或瘋或死，在懷朔的屋前眾人發現了被活活凍死的璇璣。
看見這一幕陳旭也是一言未發，昔日的清秀境地，如今的冰雪死城，兩種極端的景象，尤其是那冰雪之下掩埋的瓊華弟子更是讓陳旭心驚。
這就是瓊華派跟玄霄口中的成仙之路麼？
隨後天河等人前往捲雲臺找到玄霄，此時玄霄和夙瑤運用雙劍及大量靈力做成劍柱，以九成功力維持瓊華不墜，並引瓊華飛昇至崑崙天光處。
在於玄霄大戰之後，天河表示想為他找其他辦法成仙，只要放棄雙劍，玄霄動容，道他晚了二十二年，他一生成於修道，亦毀於修道，已經無法回頭。
隨後再次交手，一場大戰之後玄霄告誡天河讓其離去瓊華，否則不會再次手下留情了。
而就在此時，九天玄女出現，傳達天帝旨意，要將瓊華派焚燬並墜入大地，派中弟子被打入東海漩渦囚禁千年。
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玄霄不服，以命立誓：蒼天棄吾，吾寧成魔。
九天玄女見他心魔已成，便先決定將他打入東海漩渦最深處，待她另稟天帝再議生殺。
而後雲天河想讓九天玄女阻止下墜的瓊華，但卻被拒，表示一切自有天命。
如此前的玄霄一樣，雲天河也喊出了那一句：我命由我不由天。
不過玄霄是為成仙之願，而云天河只是不願山下百姓因瓊華之事而遭受災難。
另一面玄霄見天河這時仍還喊他大哥，心聲感動決定再助他一次，告訴他若想救因瓊華墜落可能涉及的山下百姓，需要他激發全身力量，再配合后羿射日弓，可毀掉下落的瓊華派。
只是以凡人之軀承受神器的威力，需要付出代價，說罷，玄霄便被九天玄女縛咒帶往東海。
最終天河利用神龍之息和后羿射日弓的力量射去了下墜的瓊華，免去了人間一場浩劫。
但接下來的劇情卻讓陳旭心裡一緊。
因為他眼前的畫面陷入了黑暗，而這也是遊戲到現在第一次出現的以黑屏代替過場動畫。
沒有等陳旭多做猜測，黑暗中一條字幕顯現：百年之後。
青鸞峰前，滿頭白發的慕容紫英站在懸崖邊，身旁當年夢璃留下的傀儡化作碎片消散空中。
一陣腳步響了起來。
‘紫英……這些年來，過的可好？’
熟悉的面孔，熟悉的聲音，柳夢璃出現在了慕容紫英的身後。
於此同時，一首回夢遊仙隨之響起。
‘……無所謂好不好，人生一場虛空大夢，韶華白首，不過轉瞬，惟有天道恆在，往復迴圈，不曾更改……你，他們等你很久了，一定有許多話要說，我先回劍冢了……’
背對著柳夢璃，輕輕揚手御劍離去。
而知曉已經是結局的陳旭這個時候突然心裡緊張了起來。
他們？
慕容紫英用的詞是他們。
天河跟菱紗難道沒有死麼？
但下一刻現實讓他的心變得拔涼拔涼的。
鏡頭切換至小屋的前面，共有兩座墳堆，一座墓碑上沒有刻字，而另一座的墓碑上則寫著：愛妻韓菱紗之墓。
墓碑前望舒劍插在了土中。
望著眼前菱紗的墓，柳夢璃也回憶起當初的往事，輕輕走了過去蹲下身子撫摸著望舒劍。
而此刻屋門也被推開，雙目失明的天河從屋子裡面走了出來。
畫面定格。
………………
至此遊戲結束。
陳旭卻感覺自己的心態要爆炸了。
什麼東西！
這是什麼結局！
菱紗真的死了？
天河還瞎了？
看著遊戲最後的開發團隊名單，很明顯這遊戲的劇情就此結束了。
儘管中間有許多的支線，他還並沒有去做，例如慕容紫英腳下的魔劍，名為姜國公主龍葵的故事。
還有懷朔與璇璣的一些故事，以及旅途中其他的一些故事。
但很顯然從一開始，《仙劍奇俠傳》就已經透過各個手段暗示著玩家，這是一個悲劇的故事了。
從淮南王陵開始菱紗尋求長生法，陳州姜氏與琴姬的故事，還有後面夏元辰與靜蘭的故事，在靜蘭死後投胎轉世七次都陪伴在其身邊，但夏元辰卻不得而知。
所有的故事從一開始就在告訴玩家，這並不是一個歡喜的故事。
陳旭現在只有一種感覺，堵得慌！
“為什麼楊總做了這樣一款讓人難受的劇情？就算當初《荒野大鏢客：救贖》裡亞瑟摩根死的時候都沒有這麼難受！”陳旭拍了拍桌子。
這並不是星雲遊戲第一次在遊戲裡面讓角色死亡了，例如《荒野大鏢客：救贖》就是主角必死的一個故事，但跟《仙劍奇俠傳》不同，《荒野大鏢客：救贖》裡面是有著多結局的，如果走善的話儘管最終亞瑟摩根死了，但他卻完成了自己的救贖，他沒有什麼遺憾了。
而《仙劍奇俠傳》這款遊戲則不同，他有著太多太多的遺憾了。
跟陳旭一樣通關後有相同感受的玩家也不在少數，通關之後看著劇情，只有兩個字虐心。
網上，各個網路社群裡面，玩家也已經討論的炸裂了。
同樣在玩家們激烈的討論，他們也得出了一個初步可信的根據。
以前的楊總不是那樣的，雖然喜歡做《黑暗之魂》這種虐他們的遊戲，但卻一直只是虐他們的手，而這一次突然虐他們的心，一定是林佳一加入其中。
而且不少玩家還研究了一下林佳一曾經的遊戲，發現他還真做過一些悲劇題材的遊戲。
這一瞬間玩家感覺到他們發現了事情的真相。
虐手變虐心，都賴林佳一！
沒跑，石錘了！