《不能說的秘密》在中音涉及的劇情按時空可分為兩部分。
第一部分是2015年時空，戲份相對較少，都是圍繞著孟小影展開，主要包括：孟小影剛考上中音，孟小影每次被穿越之後的副作用，孟小影消失前在“桌上寫字”給孔林夕隔空留言。
第二部分則是2035年時空，被穿越的孟小影和孔林夕從相戀到誤會，然後孔林夕尋找孟小影。
因為時空隔了20年，場景、道具是有所區別的，陳昆、周訊兩位客串離組之後，劇組緊接著開拍2015年時空的劇情。
魔改後的《不能說的秘密》被穿越是有副作用的，孟小影每次被穿越道20年之後，身體都會有所虛化，而且身邊的老師同學就會把她給忘記，起初幾次穿越還能透過自我介紹重新認識，但次數多了以後，剛自我介紹完，聽著的人就給忘了，身體虛化也越來越嚴重。
現場拍攝並不難，就是拍幾場茜茜對著不同的同學、老師分別做著自我介紹而已。
虛化？特效啊！
這樣的特效在九十年代就逐漸成熟了，比如1990年上映的《人鬼情未了》就有類似鏡頭。
這段副作用的劇情，在成片中只是一個快閃鏡頭，剪輯成孟小影“隔空留言”時的回憶，成片裡的孟小影在“隔空留言”之後就徹底消失，只存在孔林夕深深的腦海裡。
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這樣簡單的表演，對茜茜來說還真就並什麼難度，才短短3天，劇組就進入第二部分2035時空的拍攝。
唐燕也從學校請假進組，這姑娘自從在《仙劍·前傳》被楊柳曝光“中戲之恥”後，開學後乖乖的呆在學校發憤圖強，都大四了還跑去蹭大一、大二的專業課。
也許這就是知恥後勇吧！
老胡也正式進組。
劉思思？她在江城就殺青了！
老胡的角色姚東一開始想找個會彈琴的歌手來客串，這戲份雖然很少但很出彩，原片中的鬥琴片段可是名場面。
這種名場面，姚東不想便宜了別人，還倒欠人情！
可就這麼一個名場面，剛上映時居然有不少人說這是抄襲了《海上鋼琴師》！
在姚東看來就是無稽之談，借用其形式而已，表現手法和具體內容都完全不一樣的，連致敬都談不上！
不過這一切老胡並不知道，他倒是覺得姚東公報私仇，報的是茜茜18歲生日那句“三百六十條”的仇，存心為難他才讓他練琴。
鬥琴這場戲，場景是在中音的一個禮堂裡，涉及演員有姚東、安茜、老胡、唐燕還有一群龍套。
孔林夕、秦森（胡戈）在臺上鬥琴，鬥琴分三個回合，前兩回合相對而言簡單，都是老胡彈完之後，姚東手速更快的彈一遍。
但是到了第三回合的一開始是姚東用一隻左手彈出了老胡雙手談的曲子，隨後兩人同時彈奏，不再像鬥琴，更像是兩人的鋼琴合奏激烈而精彩，但並沒有敵意，這也是“鬥琴”片段之所以成為名場面的原因！
當然臺上還有個龍套同學做主持人。
孟小影、甄思（唐燕）並排站在一群看熱鬧的同學中看著臺上兩人鬥琴，因為孟小影這次穿越過來睜開眼第一個看到的人是甄思，所以孔林夕是看不見孟小影的，而甄思也把孟小影誤認為是其他班的同學，一直誇著臺上的孔林夕，就像炫男朋友那樣，孟小影暗暗吃醋，當然這也是孟小影之後對孔林夕產生誤會的原因之一。
如果是拍攝電視劇，這種戲就臺上臺下分開拍攝了，但是電影一般選擇的是多機位同時拍攝，當然沒錢的劇組除外。
這場戲裡的第三回合那段，吳爾善整整拍了30條，原因就是胡戈和姚東兩人配合的總是有問題，差點就沒直接後期配音了，好在最終還是過了。
雖然姚東和胡戈可以做做樣子，然後一切交給後期配音，但第一次拍電影的吳爾善還是要求盡善盡美，這部電影的音樂是非常重要的組成部分，決定了口碑的高低。
這段戲拍完，緊接著拍姚東和唐燕逛校園的戲份。
這個劇情就簡單了，孔林夕、甄思兩人在校園裡閒逛聊天，一路走到琴房，然後姚東獨自走進琴房見到一直沒找著的孟小影。
這場戲劇情簡單但在影片裡卻起很大作用，一是為劇中甄思愛慕孔林夕做的鋪墊，二是給鬥琴環節做鋪墊。
這場戲設計的對白會讓觀眾知道甄思在大學之前就知道並佩服孔林夕，同時給觀眾解釋了學舞蹈的孔林夕，是因為夢中學琴所以琴藝高超。
時間悄然流逝，已經是11月了，老胡、唐燕等人一個個也都殺青離組。
琴房。
黃磊從北電趕來客串。
客串的是聽著四手聯彈的聲音之後，推開琴房門卻發現只有孔林夕一個人的那場戲。
這又是一場簡單但重要的戲，攝影師會以孔林夕的視角進行拍攝，觀眾會和孔林夕一樣，以為黃老師開啟櫃子時看到了藏在裡面的孟小影，但因為已經是大學生的原因所以作為老師並沒有多說什麼。
也正是因為這一幕，孔林夕雖然一直認為孟小影很神秘，但也只是覺得神秘，從來沒想過其他人看不見孟小影。
這段戲會剪輯孔林夕、孟小影四手聯彈之後，正處於影片的中後期，再次確保觀眾不會在中期就猜到電影是個悲劇結尾。
當然攝影師也會透過黃老師視角拍個鏡頭，這個視角裡黃老師看到的是櫃子上其他學生寫的字而已，這個鏡頭會和其他幾個鏡頭剪輯成一個快閃鏡頭剪接在影片結尾。
雖然戲很簡單，演員表現的也都可以，吳爾善還是給拍了5條。
老吳剛喊出過“過”，錄音師、燈光、道具就開始忙活起來，接下來拍的戲是殺青戲。
吳爾善更是對兩人打趣道：“這可是殺青戲，你們兩不會也得讓我拍個70條吧？”
姚東、安茜兩人相視一笑，同聲道：“不會！”
接下來拍的是兩人四手聯彈，在拍完鬥琴之後，老吳特別這場戲安排到最後才拍的。
但老吳還真就多慮了，姚東、茜茜兩人從小就經常這樣“彈棉花”。
曲子不一樣而已，儘管茜茜有一段時間沒怎麼彈剛琴了，但鋼琴底子比胡戈好太多了。
暑假那會在家更是沒少練習，最主要的姚東和茜茜的十幾年的默契呢。
一起準備就緒後，吳爾善喊出了a！
姚東閉著眼睛背對著鋼琴，左手託著下巴，右手彈著琴。
巧笑倩兮的茜茜俯靠在鋼琴上：“你好像很喜歡一隻手彈琴噢？”
閉著眼的姚東露出靦腆的笑容左手往後伸出：“因為這樣，另外一隻手才可以牽你啊。”
茜茜嬌羞的輕拍姚東的左手，起身走到鋼琴前坐下，同時姚東也轉過身面對鋼琴，兩人開始甜蜜的四手聯彈。
吳爾善看著監視器的兩人，聽著優美動人的琴音，難免尷尬，剛剛還開玩笑說得拍70條呢。
一曲彈完，東、茜兩人甜蜜對視，又同時看向琴房的門。
吳爾善誇獎道：“不錯，保持狀態，再多保幾條！”
連著拍了10條，吳爾善的狗糧總算是吃飽了，喊出了“《不能說的秘密》殺青！”
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