來護兒長江一役大獲全勝後，除了派遣鄭成功北上奪取燕子磯之外，大部分時間都在整編南陳的降卒，因為這些降卒前身大多是某些家族的私兵，若是就這樣一股腦地收了，很有可能會出現意想不到的情況。
為了削弱江南士族在南陳降軍當中的影響力，來護兒不惜採用了最血腥的手段，將近四十名江南士族子弟全部屠殺，將所有陳軍編制打亂，所有軍官全部降為小卒，依據才能重新選拔。也正是因為如此，原來一向用兵迅猛的來護兒竟然足足耽誤了八天時間。
八天後，來護兒率領著近六萬大軍浩浩蕩蕩地北上，進入了新近被鄭成功攻佔的燕子磯大營。
剛入營寨，鄭成功就向來護兒稟報了金陵城內的南陳皇帝陳深已經寫了降表，送到了自己面前，只是自己官職卑微，無權處置此等大事，只好等來護兒到來。
來護兒身後的來整聽了鄭成功的話後，眼神中閃過一絲厭惡，“這些牆頭草，變換門庭到還真快！”
鄭成功冷哼一聲道：“這些世家大族歷來如此，不過大將軍，卑職拿下燕子磯大營時還抓獲了一人，他自稱自己是南陳派去求見陛下的使者，一開始被活捉時態度極其囂張，非說他是使者，讓我們放他去見陛下，情緒激動時還直呼陛下之名！”
“真是大膽！”來整怒哼一聲，“此等賊子若是撞到我早被我一劍刺死！”
鄭成功陰陰一笑，“來六將軍息怒，雖然末將沒有一劍刺死他，不過也好好地招呼了他一頓，到現在他還沒有辦法走路呢！”
來整大笑道：“幹得好，成功！”
來護兒的嘴角雖然也掛起了一絲微笑，但他還是強憋住了笑意，問道：“那成功，他說了他去見陛下是去幹什麼的嗎？”
鄭成功收起了笑容道：“這傢伙表面上硬氣，但實際上就是個軟骨頭，我沒用什麼刑他就全招了。他說他是在半月前奉命前去拜見陛下，表明他們江南士族願意歸順大隋的意願，並提出廢除張居正的清田司的要求，不過這傢伙和燕子磯大營守將關係極好，兩人相見大宴了一場，宿醉了四五天，因此誤了行程！”
“廢除清田司，哼，這些士族果然死不悔改！”來護兒極其厭惡地冷哼了一聲，“我大隋為何會叛亂四起？還不都是因為這些無恥的傢伙，貪婪無度，瘋狂地侵佔土地，農民活不下去了才會起來造反，居然敢提出這樣的條件，這群廢物也不看看自己有幾兩本事？”
“呼——”
來護兒深吸了一口氣，凝神說道：“成功，你和整兒率軍留守此地，我親率大軍前往金陵！”
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鄭成功聞言心生不妙，腦海中突然有了一個不妙的念頭，結結巴巴地說道：“大將軍，你...你要做..什麼？”
來護兒深吸了一口氣說道：“江南人心不附，士族私心太甚，若是不以雷霆手段鎮壓，恐怕難以長治久安，若是江南不穩，陛下便難以北伐重振大隋。”
“可是大將軍。。。”鄭成功忍了很久還是說道：“屠戮上千士族，這等罪名足以定你的死罪，縱使陛下饒你一命，您也會淹沒在士人的唾沫之中，恐怕終身都難以有所作為。”
“食君之祿，分君之憂！”
來護兒字正腔圓地說道：“江南乃是魚米之鄉，將來必是我朝的第一糧倉！若是內中不穩，必定影響陛下的北伐大業。一旦時間長了，這天下必定再次陷入南北分裂、戰亂不斷的局面，為了報答陛下對我來護兒的厚恩，這千古罵名，我來護兒替陛下背上！”
“更何況現在已經有了接替我的人，我來護兒今年已經五十有七了，征戰沙場三十多年，也累了，也該退下來了！成功，你的才能遠勝於我，我留你和整兒在燕子磯，是希望你們不要和這件事有任何的牽連。我走後，你一定要好好地訓練這支水師，完成我未竟的心願，揚我大隋國威於四海之外！”
鄭成功虎目含淚，拱手說道：“末將謹遵大將軍教誨！”
來護兒又扭頭看向來整，“六郎，為父數子當中唯有你文武雙全，最像為父，我來家的將來就交給你了！”
“孩兒...遵尊父命！”
來護兒又小心叮囑了一番，召集全軍將領宣佈道：“弟兄們，本將已經獲得可靠情報，南陳偽帝陳深雖然獻了降表，但這只不過是南陳賊子的奸計。這些賊子歹毒至極，打算趁我軍入金陵之後藉機在犒軍的酒水裡下毒將我們全部毒死，索性皇天有眼，讓本將提前得知了他們的奸計，現在本將命令，全軍殺奔金陵城，剿滅一切負隅頑抗之敵！”
“殺，殺，殺！”
隋軍將官聽了來護兒的話之後，個個義憤填膺，一個個振臂高呼大喊著發洩心中的憤怒，恨不得立刻殺盡金陵城將這些企圖暗害他們地奸賊悉數殺光！
來護兒擺了擺手，沉聲說道：“來整，鄭成功，我給你們一萬人馬駐守燕子磯，以防南陳軍偷襲。其餘眾將，隨我殺進金陵，剿滅奸賊。記住，我們是去除賊，不是去燒殺搶掠，膽敢趁亂擾民者，一律斬首示眾！”
“末將遵令！”
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來護兒率領近五萬精兵如虎狼似的殺向了金陵城，金陵城的守軍已經知道了他們的皇帝陛下已經獻了降表，根本沒有料到來護兒會率軍攻城，猝不及防之下被殺的潰不成軍，城門外兩座城防大營的陳軍只堅持了不到半個時辰便全軍覆沒，兩萬餘人被俘，來護兒留下一員偏將和五千兵馬看押俘虜，主力大軍迅速地向著金陵城發起了猛攻！
金陵城內的守軍因為城外大營的抵抗爭取到了一些時間，組織起了一點像樣的抵抗，勉勉強強擋住了隋軍的第一波突發性進攻，但是也是損失慘重。
原本巍峨雄壯的金陵城，此刻在擁有巨大優勢的隋軍面前顯得搖搖欲墜！