斑感到極為慚愧，自己連弟弟都沒能守住，當初答應弟弟泉奈要保護好宇智波族人，現在也因此辦不到了。斑清楚除了柱間沒有人能和他坦誠相待。隨後斑詢問柱間願意為了村子割捨扉間還是斑，柱間猶豫了，因為斑足夠瞭解柱間，知道這是柱間的底線，因此，宇智波斑堅持離開木葉，尋找自己想要的"真正的和平"。後來斑人間蒸發，沒有人再聽到過他的訊息。
終結之戰：若干年後，斑突然回來向木葉發起襲擊，斑企圖摧毀自己曾經與柱間一起建立的村子，柱間為了保護村子挺身而出與斑展開激烈的對戰。斑利用寫輪眼的強大瞳力操縱著尾獸中戰鬥力最強的九尾與千手柱間決鬥，而千手柱間則以仙人模式下的木遁忍術與之應戰。
這場驚天動地的戰鬥後來被刻印在世人的記憶中，夜以繼日的戰鬥改變了戰場的地形。最後柱間終於將斑擊敗，並殺死曾經的朋友，暫時守護木葉的和平，這個大峽谷在後來都被世人稱為終結之谷。
木葉為了紀念此次大戰為二人建造了屹立在終結之谷兩岸的雕像。
幕後計劃：終結之戰後，宇智波斑並不是世人所想的那樣死去，而是存活了下來。他在死前將瞳術"伊邪那岐"封印入自己的右眼，由於萬花筒寫輪眼的特性，這一瞳術在經過了若干時間之後自動啟動，改寫了斑被柱間所殺的現實，斑藉此獲得了重生。
在之前的戰鬥中，斑從柱間身上咬下了一塊肉，在復活後他將肉吐了出來，並移植於傷口處，從而順利獲得了柱間的細胞[2]。但是在移植了柱間細胞後，起初一直不曾有什麼反應，連斑自己也慢慢感到疑惑（石碑上記載著"互斥二力，相與為一，孕得森羅萬象"，斑對此深信不疑）。時間流逝，直到斑陽壽將盡之時才意外地開啟了輪迴眼。
與此同時，某個封印也因此解開，斑從封印石——月亮上通靈出十尾的軀殼，稱作外道魔像。當然，開啟輪迴眼後的斑也親眼目睹了宇智波一族的石碑記錄的最後內容（實際上已被黑絕所篡改）。於是，一場針對整個世界的陰謀就這樣拉開了帷幕。
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斑利用外道魔像為觸媒培養柱間細胞，並產生出上一次無限月讀開啟時產生的白絕。從那時起，斑便利用白絕在外收集情報，瞭解忍者世界的變更。
這時候的斑年事已高，衰老虛弱而無法行動，只能依靠外道魔像輸送查克拉勉強維持生命。為了實現自己的計劃，斑將輪迴眼移植於仙人之體後裔的年幼長門身上，希望能有朝一日能以輪迴天生之術將自己復活。然後斑一邊苟延殘喘，維持著生命，一邊等待著時機。
第三次忍界大戰期間，神無毗橋之戰結束後，宇智波斑救下瀕死狀態的宇智波帶土，以柱間細胞為其做了個新的身體。斑認為帶土這種人是可以助自己完成計劃的完美棋子，於是他利用在忍者心臟上的咒印符操縱霧忍，策劃野原琳之死事件，並藉此讓宇智波帶土徹底墮入黑暗的深淵。
最終，帶土落入了自己的圈套，認同了斑的思想。於是，斑傳授帶土一些如陰陽遁、宇智波禁術和六道之術等技能，並囑咐帶土拉攏長門，然後在集齊九隻尾獸後復活自己，展開"月之眼計劃"。把一切都交給宇智波帶土後，宇智波斑將自己的部分意志注入一隻白絕的右邊身體，創造了黑絕，以其作為帶土的助手（實際是監視）。
在完成了這些事情之後，斑自己掙脫了連線外道魔像的管道，將"宇智波斑"這個名號託付給帶土，隨後因身體機能衰竭而死。
忍界大戰：第四次忍界大戰時期，宇智波斑的屍體被藥師兜找到（黑絕引導），兜用穢土轉生之術將斑復活，並將其作為和宇智波帶土聯手的籌碼。後來為了扭轉戰場局勢，兜利用二代土影·無召喚出了宇智波斑，看到自己是穢土轉生之身，斑感到疑惑不解，但此時他也不知究竟帶土和長門的計劃出了什麼問題。
在第一次與忍者聯軍交手時，斑便展現出超強的實力，用大範圍的火遁、行雲流水的體術完全壓制忍者聯軍，導致忍者聯軍遭受了巨大的傷亡，大批忍者傾盡全力也難以傷到他，甚至無法近身。在三代土影·大野木、五代風影·我愛羅和漩渦鳴人影分身的圍攻下，斑開啟了萬花筒，直接召喚須佐能乎應戰。
為了擊敗宇智波斑，大野木將我愛羅的沙子變輕，我愛羅利用斑腳下的空隙將其拖拽出須佐能乎，此時鳴人以仙法·螺旋手裡劍向其發動攻擊，眼看著勝利在望，千鈞一髮之際斑將寫輪眼轉化為輪迴眼，吸收了鳴人的攻擊。兜透過穢土轉生的二代土影·無向斑敘述了其寫輪眼最終會進化為輪迴眼的推斷，兜的研究成果令斑頗為驚奇。
為了進一步展示力量，斑施展絕招天礙震星，猶如神一般的力量令眾人感到驚歎。最終，大野木和我愛羅未能阻止斑的忍術，無數忍者慘遭屠殺。
戰場上一片狼藉，斑以通靈之術確認帶土並未成功捕捉到九尾後，以樹界降誕向存活的大野木等人攻擊，此時，九尾感受到大敵當前，主動將查克拉輸送給鳴人的影分身對抗宇智波斑，但終究也只是強弩之末，眼看著戰場上已經無人可以匹敵斑的力量。
此時，四代雷影·艾和五代火影·綱手憑藉"天送之術"抵達戰場，五代水影·照美冥也由四代火影的護衛小隊施展飛雷神之術及時趕到，五影首次聯手抗敵。
一開始，五影憑藉人數優勢一度壓制宇智波斑，但是斑很快便施展木遁分身扭轉了局勢，當年柱間的力量和斑的力量此時結合在了一起，即便是五影也被打得毫無還手之力。危急時刻，大野木喚起了眾影，憑藉綱手的查克拉一口氣使出了超大範圍的塵遁，一口氣將木遁分身全滅，並逼退了宇智波斑本人，其他五影趁勢配合，斑看似被逼入了絕境。
此時，斑終於認同了五影的實力，於是也決定全力應戰，開啟了完全體須佐能乎。完全體須佐能乎劈山裂石的威力徹底震驚了五影，眼看五影就要命喪於須佐能乎刀下，此時兜的穢土轉生之術被宇智波鼬解除，須佐能乎消失，斑的靈魂開始昇天。