“研究系”情報組織始建於抗戰爆發之初，由於侵華日軍的步步緊逼，國民政府第九戰區長官部不得不由武漢撤到湖南長沙。時任第九戰區司令長官的陳誠，苦於缺乏情報常常對日軍行動一籌莫展。198年武漢陷落後，國民黨接受了**人的建議，在湖南衡山舉辦遊擊幹部訓練班，任命湯恩伯、葉劍英為正副主任，隨後改由蔣介石親自兼任訓練班主任，白崇禧、陳誠兼任副主任，湯恩伯、葉劍英任正、副教育長。據史料記載，遊擊幹部訓練班在衡山辦了三期。後南遷至祁陽、零陵等地，辦了四至七期，於194年停辦。
在遊擊幹部訓練班存續期間，按陳誠的旨意，在訓練班內部辦了兩個諜報隊，分別是第二期的第五隊和第三期的第十隊。由張振國親自兼隊長，阮成章由第一期畢業後，留做了情報隊指導員。這兩個隊的課目基本是情報搜集訓練，男女學生兼收。訓練課程除遊擊戰術以外，有情報業務、化裝術、通訊術、偵察術、測繪術、竊盜、交通等。這批學生畢業後，多數跟張振國一起派到了九戰區長官部參謀處，其中的女生郭雅萍、廖國瓊還分別與張振國和阮成章等先後結成了夫妻。當第五隊學生畢業時，張振國回到長沙九戰區長官部做了參謀處第二課課長。他利用這批學生，先後在湘北的瀏陽、益陽、平江、湘陰等地成立了五個情報隊。阮成章、餘誠、王子民、肖贊何、劉漢屏、肖全才等就分別是當時的情報隊長和指導員。這些情報人員後來便成為陳誠“研究系”情報活動的主要骨幹。
194年夏，鄂西會戰期間，尤其是日軍進攻宜都時，軍統和軍令部二廳的前方特工早已聞風後撤，六戰區研究室宜都情報組沒來得及後撤，只好在敵後公安縣的斑竹場附近躲藏下來。因而對日軍在宜都、松滋向五峰、長陽進犯的行動，能逐日用電報向恩施長官部報告，促使長官部下決心抓住有利時機組織決戰，並取得這次保衛戰的勝利。事後，張振國、阮成章以及宜都情報組長都分別得到“寶鼎”和“總勤”勳章。張振國趁機向陳誠請求設立正式情報機構。陳誠電請軍令部成立正式組織通訊室，得到了軍委會的批准。它設有主任、副主任(少將或上校級)和四個股(一股主管總務，二股管情報，三股管人事考核，四股管通訊)、一個無線電總檯、一個巡迴教育組；外部組織共有1個偵察班。於是，六戰區長官部通訊室就形成了一個龐大的特務組織，合計內外勤人員共有00多人，它的情報搜集範圍也就更加擴大了。
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“研究系”的主要骨幹俗稱“三頭六臂”，被稱為“三頭”的分別是張振國(遠征軍長官部調查室主任)、阮成章(海軍總司令部情報處處長)及劉莊如(第十一戰區長官部研究室主任)；“六臂”指的是楊大和(國防部二廳辦公室副主任)、陳寄生(武漢稽查處處長)、李鐵生(武漢稽查處副處長)、餘誠(情報學校處長)、周伯達(海軍情報處副處長)、阮更生(昆明稽查處處長)。