張獻忠要避免交海要塞對進攻曲靖府城的李定國部實施背刺，選擇其實並不多，一個方法是督令李定國部在全力進攻曲靖時，避開東城方向，主攻西南北三個方向，另一個方法是用大炮阻斷交海要塞內明軍出擊的道路。
是的，張獻忠轉戰河南、直隸、湖廣、江西、四川多年，手上的確有些從明軍處繳獲來的火炮，甚至還繳獲過紅夷火炮，但無論是紅夷火炮也好、大號佛郎機炮也罷，都太重了，所以，張獻忠部繳獲一路丟一路，將這些重型火炮大多譭棄了。
因此，目前張獻忠部手中較多的是虎蹲炮、碗口將軍、盞口將軍、小號佛郎機之類的輕型火炮，這些火炮是沒辦法破壞城牆及營寨工事的，但卻可以殺傷敵方人員，所以，雖然沒辦法用來協同攻擊交海要塞及曲靖府城，但用來阻止交海要塞兵馬出擊，卻是可行的。
而川黔明軍的情況非常類似，起伏的地形、崎嶇漫長的道路，使得川黔明軍沒辦法攜帶大口徑重炮進入雲南----路振飛一年前就曾經向佛山訂購了20門二千斤重的紅夷炮，可路太難走了，至今這批火炮還在半路上蝸牛爬呢，也不知道什麼時候能運抵軍前----所以，明軍和大西軍之間攻防戰的戰鬥形式就相當的復古，除了有少數火銃、霰子炮參與戰鬥外，基本上還是冷兵器時代的奮戰模式。
計議已定之後，張獻忠便呼叫炮隊去封鎖交海要塞，同時又催促擁兵4萬的李定國儘快攻下曲靖府城。
接到張獻忠命令後，李定國一臉的苦惱，沒錯，李定國根本不想硬撼兵力充足的曲靖新城，他更想做的是，在曲靖府城南北兩面虛張聲勢，然後主力置於西門方向，伏擊、圍攻城內派去支援呼應勝峰山的部隊----之前，李定國就兩次調集重兵，試圖阻攔曲靖府城內明軍馳援近在咫尺的勝峰山，其中一次失敗，讓明軍突到了正在攻打勝峰山上堡寨的馬元利和張化龍兩部的背後，迫使兩部放棄即將到時候的勝利，倉皇後撤；另一次則是成功攔住了明軍援兵，迫使其損失上千後，不得不退回曲靖府城；然而綜合下來，李定國還是覺得進行野戰更合適發揮大西軍兵多的優勢。
但現在的問題是，由於馬元利部和張化龍部已經陸續控制了勝峰山山腳處的明軍堡寨，勝峰山方向的戰鬥已經更多的向山區深處發展----明軍雖然有反攻，但由於聯絡中斷，兩處明軍已經沒辦法進行呼應作戰了----且自己那兩次伏擊阻攔給府城明軍提了醒，所以，府城內的明軍徹底龜縮起來，這就讓李定國在野戰中消滅更多守城明軍的圖謀落了空。
如今，張獻忠又下令逼迫，李定國也就算只能心不甘情不願的展開了對曲靖新城的猛攻。
只是與艾能奇部猛攻石城未果一樣，李定國對曲靖府城的進攻，在守軍嚴密佈防之下，始終沒能得手，反而損兵折將數千，讓軍中士氣全無。
其實，不單單是李定國、艾能奇兩部未能在攻城戰中得手，劉文秀部後來對沾益州城的進攻也未能奏效，也就算馬元利和張化龍兩部透過不斷填命，這才迫使曹勳、丁如龍、周雙喬三部明軍在孤立無援的情況下，放棄了勝峰山一線陣地，自勝峰山西北麓撤離，然後按照既定方案，退往尋甸府城重整。
奪取勝峰山，排除了側後方向的隱患後，張獻忠便命令馬元利和張化龍兩部協同李定國進攻曲靖新城，白文選部協同艾能奇部攻打曲靖舊城；但兩城明軍依舊據城死守，與大西軍反覆爭奪，由此展開了耗時月餘的城池攻防作戰----曲靖之戰，從明弘光四年五月初一開打，一直打到了當年的六月二十二日。
當曲靖府城明軍僅剩下萬餘兵馬、石城城內完好無損的明軍僅餘2000、沾益州明軍只剩下千五能戰之士的時候，張獻忠部卻因為兵糧不濟，及後方動亂加劇的問題，突然放棄了繼續進攻，主動向昆明方向撤退了----導致張獻忠部被迫放棄即將到手的勝利果實，突然撤退的諸多因素中，最重要的兩個原因分別是，其一，曹旭部出尋甸，向昆明展開虛張聲勢的進攻後，卻在途中意外收編了大量地主土司武裝，進而將兵力擴充至萬人規模，切實對昆明城產生威脅，並有可能導致張獻忠部的後路被截斷，最終被封閉在滇東地區；其二，在攻打曲靖的過程中，張獻忠部前後損失超過6萬，軍心動盪不已，本也無力再打下去了。
張獻忠部這一退，立刻引起了連鎖反應，大量獻軍在雲南本地招募的軍士紛紛逃離獻軍，等到張獻忠退回到昆明時，剛剛撤退時還有90000+的大西軍僅剩下了不足3萬人，而銜尾追擊的明軍卻在匯合後，保持了近4萬人的兵力，且士氣高昂，遠勝於張獻忠所部，這就迫使張獻忠放棄昆明，向西轉移，與孫可望、馮雙禮部匯合。
張獻忠與馮雙禮、孫可望部匯合後，總兵力上游7萬人，但兵糧依舊不足，反觀明軍，在控制了昆明後，一方面各地擁明武裝紛紛前來投靠，另一方面又吸納了大量的獻軍潰兵，實力膨脹到了8萬人左右，這就迫使張獻忠部放棄了反攻雲南府的計劃，一路退回到了大理境內。
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見到張獻忠連楚雄、武定等地都放棄了，一眾明軍將領及雲南士紳便鼓譟著窮追猛打，徹底消滅張獻忠餘部；好在，路振飛和趙光遠這兩名雲南當地的最高軍政長官在一片狂熱中保持了冷靜，深知眼下明軍實際是樣子貨的他們，忍住了一戰功成的貪慾，在收復姚安、楚雄後，便停止了進攻，轉而在恢復雲南生產、生活秩序的同時，開始對蕪雜的軍隊進行整頓、訓練和重編。
由此，雲南的戰事暫時告一段落······