消滅了衝入己方陣營中的滿八旗精騎後，羽林營正軍師官兵迅速重組隊形，然後向前疾行十多步，然後隨著實際指揮戰鬥的本師第一旅旅長張良相（泉水觀下院軍校一期生）的命令，向左右旋轉，然後用排銃開始驅逐還在騷擾兩個輔軍師的蒙八旗騎兵。
咦？為什麼兩翼的輔助騎兵不出手，非要羽林營正軍師主力出馬驅逐蒙八旗騎兵呢？
原因也不複雜，首先從福王府時代開始，朱由崧手下就少合格的騎兵，如今還不容易培養出8個輔助騎兵團來，按每團170戰兵計算，也不過1400騎而已，怎麼可能拿來跟清軍對耗呢？
其次，就算要對耗，單個輔助騎兵團直面的可是近自己2倍的敵人，輔助騎兵們又不能逆天，如何能以一敵二呢？
所以，輔助騎兵便從一開始就下馬持銃步射，籍此為2個輔軍師主力提供一定的火力支援，但由於單團戰兵數量太少，進而導致了齊射或狙射效果有限，不能完全壓制來去如風的蒙八旗輕騎兵，因此，最終要動用羽林營正軍師出手----當然，羽林營正軍師出手能讓己方陣線的混亂看上去更真實一些，從而誘使清軍主帥進一步誤判。
2720杆前裝線膛槍齊射的威力果然不俗，當即就把還有所想法尼堪、何洛會兩位領兵的滿洲指揮官給鎮壓了，其中尼堪連同他手下100多蒙八旗兵直接被銃彈給打死了，而何洛會雖然死裡逃生，但手臂上中了一槍，也徹底失去了戰鬥力，只能勉強的率領80多殘騎逃了回去。
又給正在回逃的蒙八旗輕騎兵安排了一頓齊射後，羽林營正軍師的官兵聽從指揮，迅速返回原來的陣線重新排列，但這種行為在遠遠觀察明軍動向的多鐸等人看來就是愈發混亂的表現，於是，在多鐸的催促下，6000清軍步卒便火急火燎的向明軍展開了全面的衝鋒。
【穩定運行多年的小說app，媲美老版追書神器，老書蟲都在用的換源App，huanyuanapp.org】
其實6000步卒只是多鐸安排的第一陣，在第一陣後，多鐸又安排了4000步卒和2000騎兵作為第二陣，於間隔50彈指（每彈指7.2秒）後出陣向明軍戰線攻擊而去----由於之前奪取定遠、來安都沒有損失兵力，因此馬汊河大戰爆發時，多鐸手中還有26000多兵馬，再扣掉剛剛損失的600多新附軍和800多滿蒙八旗兵，以及作為輔軍夥兵的2000餘人，多鐸還可以向戰場投入22000餘兵力，但多鐸也不敢做一錘子買賣，所以，還留下了10000多兵馬作為總預備隊。
由於明軍控制了位於馬汊河邊的幾個小山丘，因此，對於清軍的動向，明軍看得一清二楚，所以，一開始，除了中央戰線的羽林營正軍師戰兵部隊及兩翼輔助騎兵依舊使用遠射程的前裝線膛槍對第一陣清軍實施打擊外，並沒有動用炮兵部隊。
直到清軍第二陣的6000人，全部進入明軍炮兵的有效射程後，32門明軍大炮這才亮出了自己的“金嗓子”。
羽林營一共裝備三種火炮：即營屬攻城炮團的40斤攻城炮，正軍師下屬各旅炮隊裝備的1寸半（51mm）前裝線膛炮，以及正軍師師屬炮團裝備的1寸半前裝線膛炮和2寸（68mm）前裝線膛炮。
但由於40斤攻城炮放列重量超過3噸，非常不方便運輸，所以，這次就全留在了南京城內；實際參戰的是放列全重975公斤的1寸半前裝線膛炮和放列全重1456公斤的2寸前裝線膛炮；前者的有效射程1235米、最大射程1721米，後者的有效射程1566米、最大射程2177米；前者發射的爆炸彈殺傷半徑為3~4米，後者發射的爆炸彈殺傷半徑5米左右。
突如其來的炮擊讓第二陣清軍頓時有些不知所措----沒錯，不懂三角函數和彈道學的清軍根本不清楚為什麼己方的第一陣出擊部隊沒有挨到炮擊，偏偏是第二陣部隊遭了殃----然而這一發呆就倒大黴了，要知道第二陣清軍今天遇到的不是動靜很大，殺傷效果卻很差的實心彈，而是在半空中就會爆炸、然後潑灑出陣陣鐵雨的爆炸彈。
說實在的，由於距離相對較遠，且炮手中新兵太多，所以，羽林營炮兵部隊的射速根本沒有達到日常訓練每分鐘4發的要求，僅能保證每分鐘2~3發而已，而且一開始炮彈落地並不準確，所以炮擊了一段時間後，明軍炮火才逐漸打準了。
然而饒是如此，明軍發射的爆炸彈，還是給清軍第二陣造成了空前的災難，至少35%的出陣清軍都橫死在可怕的鋼鐵風暴中，至於剩下的若是沒有嚇傻的話，全都一鬨而散了。
在第二陣清軍被炮火擊潰的同時，第一陣清軍也沒討得好了。
這不，由於之前連續用線膛槍擊敗清軍步兵和騎兵，精神大振的羽林營正軍師的新兵們的心態越來越好了，這就導致了羽林營正軍師各部戰兵的裝填速度有顯著提升，進而每分鐘內齊射速度也得到了增加，如此一來，就使得清軍第一陣承受的壓力，隨著他們不斷逼近明軍戰線而越來越大。
前方，本部中最精銳者一排排的倒下，後方，又傳來的連珠般不詳的爆炸聲，頓時讓很多新附軍官兵感到了不妙，因此第一陣清軍中不少人開始脫隊逃跑了，並且隨著時間的推移及己方傷亡的增加，轉身逃跑或裝死的清軍越來越多，最終導致清軍第一陣的進攻，就此自行瓦解。
判定兩陣清軍崩潰後，清軍已經失去主動進攻能力，極有可能立刻逃竄的羽林營參謀小組及時的向張茂德建議發起全線進攻，張茂德火速向朱由崧做了報告。
“如此說，大局已定了？”看著面前的張茂德及楊存孝等人，朱由崧輕笑道。“那就展開反擊吧！”
張茂德領了朱由崧的旨意，當即命令道：“重甲兵留守保衛炮兵、工兵和陛下，其餘各部立刻發起反擊！”
朱由崧想了想，起身來到軍鼓前，伸手從力士手中接過鼓槌，然後在張茂德的示意下，重重的敲響了軍鼓，與此同時，原本的監國親王旗被降了下來，一面代表朱由崧的皇帝大旗重新升了上去。
注意到敲擊進軍鼓的身影----朱由崧特意穿了皇袍----和新出現的皇帝大纛，參戰明軍各部頓時山呼海嘯起來，隨即，這些士氣爆棚的明軍開始向清軍反推了過去。