“姐姐，甲板上的情況怎麼樣，我怎麼感覺海上的風暴好像越來越大了。”一向沉穩冷靜的少女聲音裡也有了幾分焦急。
“大君，我們還是在向奇蹟島行駛嗎？”文靜的年輕女子此刻的聲音裡也充滿了驚慌。
“諸星先生，風浪太大，船上的桅杆好像快倒了，怎麼辦？”在甲板上調整風帆的師傅也一時不知所措。
與船上其它三人焦急而驚慌的聲音相比，駕駛室裡年輕男子的聲音一如既往的冷靜厚重，給人一種心安的感覺，“兩位小姐不要著急，現在的情況不太妙，但終歸有辦法的。別緊張，俯下身子，我們要調轉船頭了。”
年輕男子一邊在掌舵，一邊密切注視著狂風呼嘯的大海，當海面稍微平靜的時候，他竭力把握住船的航行方向，當海浪打來時，他輕盈地調整航向避過浪頭，防止船被海浪掀翻。
這是三月上旬一個傍晚日本東京灣附近某片海域傳來的對話，一艘有著兩面風帆，裝有柴油發動機的藍色小遊艇在風暴肆虐的大海上頑強地經受著海浪的洗禮。
（作者解釋：東京灣，是一個位於日本關東地區的海灣，因與東京接壤而得名，古稱江戶灣，東京灣有多摩川、鶴見川、江戶川、荒川等多條河流注入。近代以來，東京灣內開始了海堡的建造，所以灣內有很多人工島。）
藍色的遊艇上有四個人，坐在船艙裡的兩位少女分別是南洋大學大二女學生宮野明美和她的妹妹，年僅十五歲，卻有著絲毫不遜於成人成熟的宮野志保；站在甲板上調整風帆的是一位姓山田的中年師傅；最後一位是在駕駛室裡淡定地駕駛著遊艇與風浪搏鬥的男青年，他的名字叫赤井秀一，是FBI（美國聯邦調查局）新人特工，不過他現在的身份是日本南洋大學化學研究生諸星大。
為什麼在這個颱風呼嘯的夜晚，赤井秀一和宮野姐妹會乘坐小遊艇在海面上遊弋？這一切還要從頭說起。
一年前，剛剛成為FBI特工的赤井秀一終於如願被派回了日本執行任務，直面導致他家破人亡的黑衣組織。按照FBI為他制定的作戰計劃，他先以南洋大學研究生諸星大的身份，接近一位黑衣組織邊緣成員，南洋大學大二女學生宮野明美，然後在透過明美結識她的妹妹，年僅十四歲就因其在化學和生物制藥方面的突出才能而成為黑衣組織藥物研究員的天才少女，代號Sherry的宮野志保，再以宮野姐妹為介紹人，加入黑衣組織成為FBI監視組織動向的臥底。
（作者解釋：在《名偵探柯南》動漫裡，黑衣組織的慣例是組織BOSS會給每一名組織中高級幹部賜予一個酒名作為代號。）
事情的進展比他想象得還要順利，透過一場人為製造的“車禍”，他成功博得了宮野明美的好感，隨後幾次恰到好處的“英雄救美”，讓他陰差陽錯地成為了明美的“男朋友”，以“姐姐的好朋友”的身份獲得了明美的妹妹志保的信任，成功臥底黑衣組織。
雖然已經臥底黑衣組織近一年的秀一目前還只是組織罪基層的行動人員，也沒有太多機會接觸到有關組織的重要情報，但是在這一年的時間裡，秀一已經透過各種手法結識、收買和利用組織大大小小的幹部們，旁敲側擊地從他們口中獲取可能有價值的一切情報，有意無意展示自己在射擊、搏擊和化學等方面過人的才能，在組織初步建立起一套屬於自己的關系網。
而現在關系網開始初步發揮作用了，三天前的下午，在秀一與宮野姐妹合租的高層公寓的客廳裡，明美面色凝重地將一個信封交給了正在喝下午茶的秀一，“大君，剛才Bourbon來找我，說是組織為了考驗新人，讓你來執行這樣一項任務。”
（作者解釋：Bourbon，原名安室透，9歲，黑衣組織的偵探，曾經是警視廳警察學校第一名畢業的學員，收集情報能力極強。在本系列柯南同人文中，他是日本警方在黑衣組織的臥底。）
秀一開啟信封，仔細看了看裡面的內容，用特製的點菸器緩緩點燃一支薄荷味的香菸，默默地盯著掛在牆上的日曆，半晌沉默不語。
看到秀一沉默的樣子，明美有些擔心地說，“大君，如果實在不方便的話，你也不要勉強自己，我可以再去和Bourbon商量一下。”
“到底是去還是不去，如果你還是個男人的話就請乾脆一點，你沒有看到姐姐已經很為難了嗎？”茶發少女直截了當對秀一說道，儘管這一年來“諸星大”對自己和姐姐頗為關照，自己也開始慢慢接受他，但是志保心裡始終對這個身份來歷均不明，突然闖進自己和姐姐生活中的“不速之客”有一種隱隱約約的不安和危險的感覺，當然後來的事實證明她的第六感驚人的準確。
秀一趕緊解釋道，“我不是不想去，而是在思考應該怎麼去完成這個任務。”
【穩定運行多年的小說app，媲美老版追書神器，老書蟲都在用的換源App，huanyuanapp.org】
“這個任務到底是什麼，你還沒有告訴我們呢。”志保的聲音有些無奈。
“是這樣的，組織讓我協助一位剛從美國回來的組織成員Liqueur，與一位名叫麥利亞託的義大利商人進行情報交易。”不知為什麼，作為FBI特工的赤井秀一，在宮野志保這個十五歲的少女面前，總是顯得有點弱勢。這究竟什麼原因，秀一自己也百思不得其解，唯一可以明確的是，這裡面大概是夾雜了很多從過去到現在的複雜的感情因素。
（作者解釋：Liqueur，利喬酒，因大多為濃稠甜膩，所以也可稱為香甜酒和甜露酒。其製造方法是採用釀製或蒸飲餾類原酒作為基酒，再添混必所需材料，而形成所添混物之特色的酒。利喬酒約可分為果實和藥物兩種型別，前者如可可酒、櫻桃酒等等。後者則屬飲療保健用途，且多為世傳獨門秘方，很多以家族名稱命名，如愛爾蘭迷霧、君度等等。）
“什麼時候去執行任務，交易地點在哪裡？”志保追問得滴水不漏。
秀一老老實實地回答，“三天以後，就是這週六，地點是東京灣附近的奇蹟島，那裡原本是一個無人荒島，不過半年前被那個義大利商人買下來了，在那裡建了私人別墅，所以他和組織約在他的別墅裡進行交易。”說到這裡秀一有點歉意，“本來這週六是想陪你們姐妹倆到秋葉原去逛街的，現在看來是沒有時間了。”
（作者註釋：秋葉原，是日本東京的秋葉原世界上屈指可數的電器街，除了電器商品專賣店之外，還擁有多家電子遊戲和動漫產品專門店，商務、飲食等服務功能也十分齊全，現在已經發展成為一個具有綜合性色彩的繁華區域。）
到底是十五歲的單純少女，看到一面愧疚的秀一，志保的語氣也緩和了很多，“我們三個一起出去玩不一定非要去商業街，一起去海島呼吸一下新鮮空氣也不錯嘛。要不你帶上我和姐姐也一起去奇蹟島吧。”
志保大膽的提議把秀一和明美都下了一跳，明美立刻輕聲斥責道，“志保，不要太任性了，大君是去執行組織重要任務的，又不是出去旅遊，怎麼能帶上我們一起去呢？”
志保自己也感覺到剛才的提議有些不妥，悻悻地低下了頭，“對不起，是我想得太簡單了。”
“沒關係的，志保的提議也有一定道理，我們三個去哪裡玩都可以，這次任務也不算太複雜，就當我們三個一起去海島旅遊也未嘗不可嘛。”之所以或同意志保的要求，給自己的臥底行動加入不確定的變數，完全是秀一複雜的私人感情，這其中既有對利用宮野姐妹臥底打入黑衣組織的愧疚，更有對她們，特別是被迫承受了她這個年齡不該承受了很多東西而顯得異常成熟的志保的關愛和憐惜。
自幼失去父母，被黑衣組織收養的宮野姐妹，姐姐明美尚能和父親生前的好友一起生活，除了偶爾受到組織的監控，大部分時間還能夠像普通的同齡女孩一樣過著正常的生活，而妹妹卻因為其在化學和生物制藥方面過人的天賦，從小就在組織嚴密的監控下，按照組織的安排生活，雖然年僅十四歲就取得了化學和生物制藥雙學士學位，但是她在個人生活可謂是十分單調乏味，幾乎從來沒有像正常的孩子一樣享受過童年的歡樂。由於從小目睹了黑衣組織內部成員的之間殘酷的爭權奪利的鬥爭，她的性格十分謹慎，除了姐姐之後，從不輕易相信他人，就連秀一也花了近一年的功夫才取得了她的基本信任，因此在某種程度上，年幼的志保還是相對天真單純的姐姐宮野明美的保護神。難得可貴的是，即使在這種氛圍下長大，志保還是保持了直率和善良的天性。因此對志保這個早熟的女孩，秀一有一種近似乎於寵溺的感情，也正是因為如此，當看到志保為一些對年輕貌美的姐姐糾纏不休組織的男成員感到十分頭疼的時候，秀一挺身而出，自稱是明美的“男朋友”，讓宮野姐妹住進了自己租住的高層公寓，不讓那些好色之徒再有機會去騷擾宮野姐妹。不料志保因此真的把自己當成了“準姐夫”來看待，這讓秀一一時不知如何解釋。
沒想到秀一居然真的同意了志保近似於胡鬧的提議，這讓宮野姐妹十分驚訝，兩人幾乎是異口同聲地問，“我們和你一起去奇蹟島，這樣真的可以嗎？”
看到秀一微笑著點了點頭，姐妹倆立刻去收拾準備行李，興奮之情溢於言表。
到底還是少女，還是處在愛玩的年齡。望著高興的宮野姐妹，秀一也感到一種久違的屬於家庭的溫馨感，不過很快他就讓自己迴歸到FBI臥底特工的角色，繼續研究如何完成組織指派的任務。
在三人準備出發前往奇蹟島的前一天中午，剛剛睡完午覺的宮野姐妹就看到秀一擰著一隻巨大的行李箱回來。
“大君，這箱子裡裝得是什麼？”明美好奇地問。
秀一得意地拍了拍箱子，“這個是水手專用的行李箱，裡面都是海上生活必備的東西！”
“呵，還挺神秘的樣子！”志保表面上一副不以為然的樣子，心裡卻也對箱子裡的東西很好奇。
明美突然想起了什麼，拿起一封信遞給秀一，“這個是今天早上我在信箱裡看到的，是你的信。”
秀一開啟信看了一眼，微微一愣，然後微笑著說，“原來是催繳電費的單子啊，哎，看來最近又要破費了。對了，你們的行李收拾得怎麼樣了，讓我看看吧。”
其實，那張所謂“催繳電費的單子”真實內容如下：
“來自幽靈水手的警告：切勿前往奇蹟島，否則有去無回。”