護法戰爭失敗後，國務總理段祺瑞也沒有成為贏家，新一輪的府院之爭使他疲於應付。北洋時期，總統府與國務院之間的權力鬥爭有兩次，兩次都是國務總理段祺瑞與總統之爭。
第一次，總統是黎元洪，黎元洪因為手上無軍隊，段祺瑞在最後勝出，黎元洪隱退。第二次，段祺瑞的對手卻是同樣擁有軍隊的馮國璋。張勳復辟後，段祺瑞做回總理，立即給身為副總統的馮國璋發了一封電報，電文只有四字“四哥快來”。
馮國璋安排妥當後北上就任代理總統。
在就職通電中，馮國璋特別強調，只有“府院一體內外同心”，才可能實現國家統一。號稱北洋三傑的王士珍、段祺瑞和馮國璋，早年投身袁世凱門下，為北洋集團建功立業，成為聲名遠播的北洋的“龍、虎、豹”。此時北洋之龍王士珍由於當過復辟的幫兇，已無作為。而段、馮兩位“虎豹”，在袁世凱在世的時候，已經開始形成了各自的派系，段為皖系，馮為直系，直皖矛盾隨著南北衝突而日益凸顯。
10月6日護法戰爭爆發，正當段祺瑞全力對南方用兵之際，馮國璋提出了“和平統一”的政策，即承認西南各省軍閥割據的現狀，以換取他們對北京中央政權的承認。
由於馮國璋的運作，段祺瑞征討南方的戰爭徹底失敗了。11月19日段祺瑞被迫辭去了陸軍總長的職務，日辭去了國務總理的職務。馮國璋立即啟用贊成”和平統一“政策的王士珍，接替段祺瑞國務總理兼陸軍總長的職務。
段祺瑞不甘心“武力統一”的失敗，一方面組織督軍團天津會議，鼓吹對南方繼續用兵；一方面又說動了奉系大帥張作霖，派兵入關威脅京畿。此時馮國璋在北京的總統府衛隊只有兩個師，力量單薄。
1918年1月中旬，護法戰爭重燃戰火，馮國璋在北京陷入了空前的孤立。1月6日，馮國璋借出京“巡視”為名，想回到自己的勢力範圍南京，商討反段大計。段祺瑞命皖系安徽督軍倪嗣沖攔截。奉軍又實行了“兵諫”，皖奉聯合，馮國璋只能請出段祺瑞，再次出任國務總理。
1918年8月新國會成立了，段祺瑞掌控下的安福系成為第一派系，9月新國會選舉徐世昌為新任總統。馮國璋下臺了，段祺瑞也同時請辭，但不久轉任督辦參戰事務處的督辦，仍然把持著朝政。
安福系與皖系軍閥
護法戰爭期間，直、皖矛盾日趨尖銳，馮國璋和段祺瑞形同水火。皖系依靠日本大量貸款和軍火援助，組織了一支“參戰軍”，軍事實力得到顯著增強；同時又從政治上下手，力圖透過新的國會選舉，選舉段祺瑞或能為皖系所用的人當總統。
為此，皖系軍閥和依附皖系的官僚、政客，在臨時參議院召開前後加強了聯絡，安福俱樂部應運而生。早在1917年8月，依附於皖系的政客王揖唐、曾毓雋等人就經常在北京宣武門內的安福衚衕梁式堂的住宅聚會，不過很少涉及政治。1918年月6日，北京政府發布命令，定於5月0日和6月10日舉行眾議院議員的初選和複選；6月0日舉行參議院議員選舉。月7日晚，王揖唐、曾毓雋以及王印川、鄭萬瞻、劉恩格等人在安福衚衕開會，決定成立組織，不以政黨相標榜，謂之安福俱樂部，即以所在衚衕定名。
安福俱樂部也稱安福系，有完整的組織系統，下設幹事部、評議會、政務研究會。
幹事部由王揖唐任主任，曾毓雋、王郅隆任常任幹事。評議會由田應璜擔任會長，吳文瀚、王印川擔任副會長。政務研究會由李盛鐸擔任會長，秦望瀾、克希克圖擔任副會長。這是一個為皖系軍閥牟取派系和個人私利的軍閥、官僚、政客的集合體。
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安福俱樂部成立後，在段祺瑞、徐樹錚指揮下，又取得舊交通系首領梁士詒萬元鉅款的援助，因此透過賄賂大肆操縱選舉。國會共選出參議員147名，眾議員5名，其中安福系佔有84名，佔總數的80％。安福系如願以償成為國會的唯一支配者。
8月1日，安福國會召開後，第一件事就是讓馮國璋下臺，選舉徐世昌當大總統。這件事遭到西南護法各省及直系軍閥吳佩孚的反對。西南護法各省依據《中華民國臨時約法》，認為這次兩院議員的選舉是非法的，拒不承認安福國會。吳佩孚一貫反對皖系，這時也與西南方面聯合起來，通電各省，主張另選總統。
直皖矛盾並未因馮國璋、段祺瑞同時下臺而消弭，反而愈演愈烈，190年月終於爆發了直皖戰爭，結果皖系失敗。北京政府為直、奉兩系（以直系為主）所控制。8日，北京政府免去段祺瑞本兼各職，9日，明令懲辦徐樹錚、曾毓雋等安福系十大禍首。8月日，下令解散安福俱樂部，7日，通緝王揖唐及安福系其他重要首領。8月0日安福國會宣佈閉會。（未完待續）