據《水經注》記載，東漢以後，由於當時塔里木河中游的注濱河改道，導致樓蘭嚴重缺水。
敦煌的索勒率兵1000人來到樓蘭城，又召集鄯善、焉耆、龜茲三國兵士000人，不分晝夜橫斷注濱河引水進入樓蘭城緩解了樓蘭缺水困境。
但在此之後，儘管樓蘭人為疏浚河道作出了最大限度的努力和嘗試，但樓蘭城最終還是因斷水而廢棄了，民眾南移，樓蘭城最終成為今天的遺蹟。
距今約1600年前樓蘭古國消失，只留下處古城遺蹟。地處羅布泊的西北角、孔雀河道南岸的7公里處。
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史書又記，漢武帝初通西域，使者往來都經過樓蘭。樓蘭屢次替匈奴當耳目，並攻劫西漢使者。
元封三年（前108），漢派兵討樓蘭，俘獲其王。樓蘭即降漢，又遭匈奴的攻擊，於是分遣侍子，向兩面稱臣。
匈奴侍子安歸立為樓蘭王，遂親匈奴，成為了漢朝的心腹大患。曾在漢朝做質子的王弟尉屠耆親漢。
昭帝元鳳四年（前77），漢遣傅介子到樓蘭，刺殺安歸，立尉屠耆為王，改國名為鄯善，遷都扜泥城（今若羌附近）。
其後漢政府常遣吏卒在樓蘭城故地屯田，自玉門關至樓蘭，沿途設定烽燧亭障。魏晉及前涼時期，樓蘭城成為西域長史治所。
公元400年，高僧法顯西行取經，途經此地，他在《佛國記》中說，此地已是"上無飛鳥，下無走獸，遍及望目，唯以死人枯骨為標識耳"。
樓蘭城--這座絲綢之路上的重鎮在輝煌了近500年後，逐漸沒有了人煙，在歷史舞臺上無聲無息地消失了。
公元4世紀之後，北魏滅鄯善國，約600年鄯善國（樓蘭國）至此滅亡。
千百年來，對於樓蘭的消失，眾說紛紜。
有說樓蘭的死亡，是由於人類違背自然規律導致的，樓蘭人盲目濫砍亂伐致使水土流失，風沙侵襲，河流改道，氣候反常，瘟疫流行，水分減少，鹽鹼日積，最後造成王國的必然消亡。
也有人說給樓蘭人最後一擊的，是瘟疫。
這是一種可怕的急性傳染病，傳說中的說法叫"熱窩子病"，一病一村子，一死一家子。
在巨大的災難面前，樓蘭人選擇了逃亡——就跟先前的遷徙一樣，都是被迫的。
樓蘭國瓦解了，人們盲目的逆塔里木河而上，哪裡有樹有水，就往哪裡去，哪裡能活命，就往哪裡去，能活幾個就是幾個。
樓蘭人欲哭無淚。他們上路的時間，正趕上前所未有的大風沙，是一派埋天葬地的大陣勢，天昏地暗，飛沙走石，聲如厲鬼，一座城池在混濁模糊中轟然而散...
至此，輝煌的樓蘭古城也就永遠地從歷史上無聲地消逝了。
有專家們指出，孔雀河與車爾臣河匯入塔里木河，經庫魯克河流入羅布泊。
羅布泊是古樓蘭的生命之源，羅布泊的遷移，使樓蘭水源枯竭，植物死亡，導致了氣候惡劣，樓蘭人繼續留在這裡只能坐以待斃，於是他們只好棄城別走，樓蘭古城也就在歷史上消失。
許多學者也認為，古樓蘭的衰亡是與社會人文因素緊密相連的。
中國古書記載樓蘭古國的最後存在時間在東晉十六國時期，這正是中國歷史上政局最為混亂的時期，北方許多民族自立為藩，相互戰爭。
而樓蘭正是軍事要衝、兵家必爭之地。頻繁的戰爭、掠奪性的洗劫使樓蘭的植被和交通商貿地位受到了毀滅性的破壞。
沙漠邊緣的古國，喪失了這兩個基本要素，也不可能存在下去。於是，它就變成了今天滿目黃沙、一片蒼茫的景象。（未完待續）