再後來，宇智波佐助被大蛇丸拐跑，鳴人等人透過曉組織的蠍掌握了大蛇丸的線索，準備前往天地橋。但因為失去了佐助，卡卡西又負傷住院，第七班人員不足，無法繼續任務。於是團藏安排年齡相仿的佐井填補第七班的空缺，"佐井"也正是為這次任務才臨時取的名字，除非任務需要，根組織的孤兒派只有代號。但團藏當然不會白送一個部下，他另有圖謀。
出於對新同伴的好奇，佐井提前試探了一下鳴人的實力。感受到對方毫無威脅的攻擊，他笑眯眯的說出了第一句臺詞："你也算是帶把的嗎？"佐井雖然實力不錯，但他的社交經驗為零，剛剛脫下面具的他還不知道怎麼說人話。
如果只是鳴人倒也罷了，但第七班還有一個脾氣火爆，怪力驚人的小櫻。最讓佐井印象深刻的一次，是當他表示："想要成為第七班的一員"時，鳴人說："你只是在佐助不在時被選來填空的，我絕不認可你是我們的一員！"雖然鳴人這是不想承認失去佐助的真情流露，但這話還是挺傷人的。
於是佐井直言不諱："背叛木葉，投靠大蛇丸，我可不想和這種垃圾相提並論。"小櫻先是道歉："對不起，鳴人說得有點過火，請原諒他吧"，然後笑容滿面的走上前，一拳將毫無防備的佐井揍飛，"我你就不必原諒了！"
雖然佐井一開始沒能融入第七班，不過他們有一個靠譜的隊長，大和。由於卡卡西在上次任務中負傷，綱手指派暗部中最優秀的大和擔任新隊長，"大和"其實也是為任務臨時取的名字，在暗部時他原本叫"天藏"，而在更早前他是根組織的"甲"。
出身於根的大和可以理解佐井的不善言辭，同時也明白他是團藏手下的危險人物，於是一方面請大家泡澡、吃大餐，促進隊員和睦相處，另一方面將可以追蹤的木遁**放入料理中，悄悄掌握了佐井的行蹤。
到達天地橋前，一行人在大和自帶的木遁三室一廳裡商討了戰術。由於他們要見的是蠍安排在大蛇丸那邊的間諜，於是大和打算利用木遁偽裝成蠍的樣子，趁對方放鬆警惕時，四人偷襲活捉間諜，逼問出大蛇丸和佐助的下落。但他們沒想到的是，所謂的間諜是藥師兜，早已背叛了蠍，更沒想到大蛇丸本人也來了，他們的目的是在天地橋設伏殺蠍。於是偽裝成蠍偷襲的戰術失去了意義，他們只能正面迎敵。有趣的是，敵我六人，有四個都在根組織待過。
鳴人看到大蛇丸，直接怒不可遏的進入了三尾狀態。大和沒有第一時間用木遁制止，面對大蛇丸這種級別的敵人，他們需要鳴人暴走的力量。然而戰鬥開始後，小櫻被鳴人吹飛的兜砸到，昏了過去，佐井則完全沒有要救隊友的意思，所謂融入第七班僅僅為了接近大蛇丸，他現在要執行團藏交給他的極秘任務了。
大蛇丸與四尾鳴人一番激戰過後，因為臨時轉生的身體到達極限，只能撤退。這時佐井出現在大蛇丸面前，將團藏的見面禮交給了他，竟然是一份木葉暗部全體成員的檔案。
這對木葉村來說極度重要和危險的機密，試想一下一個國家所有特工的身份全部暴露。佐井表示："團藏大人想與您合作，顛覆木葉村，自己則充當雙方的聯絡人。"
大蛇丸感受到了團藏的誠意，將佐井帶回據點，佐井也終於見到了久聞其名的佐助。他對佐助說："鳴人一直在找你，聽說他把你當兄弟。"佐助冷冷道："我的兄弟只有一個，是我想殺掉的男人！"
為什麼佐井要當著大蛇丸和兜的面說這些？恐怕一路上，他看到鳴人對佐助的執著，喚醒了封存在心底的記憶，他很好奇佐助是怎麼想鳴人的。
此時大和靠著佐井體內的追蹤器，帶著鳴人、小櫻追到了大蛇丸的巢穴，抓住佐井後，準備去救出佐助。佐井卻勸鳴人放棄："我剛才見過佐助了，你們不可能成功，他根本不把你當兄弟。"
鳴人沉默了片刻，鄭重的說："佐助和我一樣沒有家人，他是這世上最認可我的人，是我的朋友，是好不容易才建立起來的羈絆，就算是打斷手腳，我也要把他帶回去！"
鳴人的嘴遁觸動了佐井的心，他想起同樣是孤兒，彼此視作親人的自己和信。這時藥師兜出現，看到佐井被木遁捆住，他以為佐井還是站在他那邊的，於是破開他的束縛，放心的把背後交給了他。結果佐井默默一記擒拿制住了兜，佐井："所謂羈絆，我想親眼驗證一下"鳴人的嘴遁竟恐怖如斯，前根組織第一間諜栽在了臨場倒戈的晚輩手裡。
佐井重新歸隊，和鳴人一起尋找佐助。看著鳴人不顧剛從四尾狀態恢復的傷痛，即使昏倒也不想停下腳步的樣子，佐井想起了他的哥哥，以及想給哥哥看的那幅畫。他拿出筆，為畫冊畫上了結局：位於首頁的哥哥，和位於尾頁的自己，戰勝一個又一個妖魔相向而行，最後笑著緊握雙手。
佐井第一次發自內心的笑了，這不是自相殘殺的故事，而是孤身一人的自己和信，在這個殘酷世界裡終於找到彼此的故事。就像信一開始就做好了病死在決鬥中的打算，他也從未想過把哥哥當做敵人，他和信的羈絆，沒有一絲瑕疵。
佐井不再顧慮團藏的命令，他一定要讓鳴人和佐助重逢，於是佐井先行一步，用超獸偽畫的追蹤術找到了佐助的位置。
不過此時大和在佐井的包裡發現了一本暗殺名簿，最新一頁上赫然就是佐助。原來團藏交給佐井的真正任務，是除掉大蛇丸的轉生容器，暗殺威脅到木葉的叛忍佐助，之前勾結大蛇丸顛覆木葉的計劃只是為獲取信任的幌子。不過那份暗部資料是真的，團藏視直屬火影的暗部為眼中釘，他不介意大蛇丸將其除掉。
鳴人一行人又開始緊**來，難道佐井那家夥是去殺佐助了？並不是，佐井此時只想把佐助帶回木葉。但三年未見的佐助實力早已今非昔比，雖然被佐井偷襲束縛，但微微抬手便炸出一個大坑。鳴人等人聽到動靜趕過來，終於見了日思夜想的佐助。
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小櫻一把抓住佐井的衣領："你究竟要背叛我們幾次？"這時佐助說："他就是我的後補嗎？又進來了個天真的傢伙，說什麼要保護我和鳴人的羈絆。"
佐井一面對小櫻說："我已經不在乎任務了"，一面對佐助說："鳴人和小櫻為了你拼死追到這裡，你應該能夠理解這份羈絆。"
佐助回答："我理解，但現在我已經有了名為復仇的羈絆，太多羈絆只會讓自己迷茫，所以我要在這裡斬斷！"佐助決心這次要殺掉鳴人。
這個時間點，佐助的實力遠在鳴人之上，他的寫輪眼已經能夠抑制鳴人體內的九尾。當佐助準備使用新開發的S級忍術麒麟時，大蛇丸和兜攔住了他。兜："留他們一命吧，讓他們多幹掉幾個曉的成員。"這讓佐助好不容易下定的決心動搖了，只好跟著大蛇丸離開。這次行動，鳴人他們沒能帶回佐助，但他們收穫了第七班的新同伴，佐井。
回到木葉後，佐井向團藏覆命，沒想到團藏不但沒有責罰他任務失敗，還答應了他留在第七班的請求。只是看到他露出真心的笑容後，提醒他："情感只會滋生憎恨，而憎恨會製造戰爭。"今天的團藏出乎意料的不壞。
此後，鳴人意識到和佐助的差距，開始修煉S級忍術風遁螺旋手裡劍，佐井則泡在圖書館，很努力的學習該怎樣與人相處。之前想要融入第七班是為了任務方便，現在的他真心想和大家成為朋友，於是自上次的"假笑"後，他又學會了新技能："綽號或愛稱可以產生親近感"，教科書上是這麼寫的。於是他向鳴人、小櫻請教，該怎樣給同伴起綽號。
小櫻看到佐井的改變很開心，答道："只要說對方的特徵就好了。"於是佐井仔細端詳了一下小櫻，開始了實踐——"醜女"。看到小櫻暴走，佐井還一臉無辜的問："怎麼了嗎？"
從根組織出來後，佐井的圈子不只有第七班，他還認識了木葉十二小強們，首先遇到的豬鹿蝶班。井野剛一見到佐井就臉紅了，顏控的她興奮對小櫻說："很帥呢，有一點像佐助。"小櫻回憶著剛才的綽號，心想你太天真了。隨後第七班和豬鹿蝶一起吃烤肉，井野坐在佐井身邊，熱情的給他夾肉，這時佐井的表演開始了。
他心想這是第一次見到新同伴，第一印象很重要，於是決定給他們起綽號。特徵嘛...看到因烤肉饞著流口水的丁次，佐井脫口而出："肥..."鳴人一把摁住他的嘴巴："肥豬是丁次的絕對禁句，千萬不能說啊！"
於是佐井又將目光投向了身邊的井野，井野倍感壓力，小櫻則在心裡吶喊"上啊，佐井！！！"不過佐井卻從小櫻的綽號慘案上吸取了教訓，心想："如果對女生直接說出特徵會讓她發怒，也就是要反著說。"他想了想，對井野說："美女。"
井野先是吃了一驚，隨後有些害羞，"不但人長得帥，說話也很直白呢"。但對面小櫻再次炸毛了，小櫻："為什麼遇到井野綽號就變成這樣了！"佐井再次被揍，這是一道雙向送命題。
不過這是完全值得的，佐井的一句美女，在井野的芳心上縱了把火，不善言辭的他，最後被這個擅長讀心的姑娘領回了家，出身於根組織，無名無姓的戰爭孤兒，終於有了自己的名字——山中佐井。
佐井加入主角團後發生了很多事，他看著鳴人終於練成螺旋手裡劍，打敗了曉組織的角都；他參加了第二次佐助奪回行動，觀賞了前所未有的爆炸，看到了宇智波一族的戰場，以及鳴人的不甘；他看到木葉村被佩恩毀於一瞬，團藏伺機登上火影之位，又死於佐助之手；他看到了小櫻為保護鳴人向他告白，被鳴人一眼看穿。佐井經歷了他所缺失的世間百態，內心逐漸充滿情感，當年根組織的那個封印術，似乎到了完成的時候。
後來第四次忍界大戰爆發，佐井遇到了被穢土轉生復活的信。看到哥哥被敵人操縱，還被製成了迴圈使用的**，佐井怒了，用超獸偽畫畫出兩尊羅漢，將敵人擊落至勘九郎的傀儡陷阱中。而信也看到了那本他送給弟弟的畫冊，信："原來如此，我終於看到了期待已久的畫。"信再也沒有遺憾，他確認了兄弟間的羈絆，也明白弟弟現在一定過得很陽光。
信衝破束縛，主動解開了穢土轉生，靈魂昇天，他們兄弟二人，無論生死，絕不為敵。
後來佐井所在的部隊對上了霧隱忍刀七人眾，對方實力強悍，同時擁有穢土轉生的不死之身，相當棘手。於是忍者聯軍本部送來了那個根組織的巨大卷軸，希望佐井能夠使出強力的封印術，為了戰勝敵人，佐井只能盡全力試試。
剛開始的時候，他又像當年那樣被負面情感吞噬，險些失控，但很快，他就意識到自己和從前不一樣了，現在的他也有了很多同伴，有了各種各樣的經歷與情感。將保護同伴心意注入畫卷，佐井終於完成了這個根之封印術——虎視眈彈。
在動畫中，這個虎視眈彈一招封印了忍刀七人眾的兜割，而在漫畫中，是封印了鬼鮫的上司西瓜山河豚鬼。可以推測，穢土轉生的忍刀七人眾大部分應該都被這個術封印了。甚至後來斑爺和柱間拼到兩敗俱傷時，佐井還試圖用這招去撿漏。可惜當老虎咬到斑時，斑被輪迴天生徹底復活了。
忍界大戰結束後，佐井從木葉小強之十三變成了之十二，一開始他填補的是佐助的空缺，最後空缺變成了寧次。
值得一提的是，根組織在團藏死後便徹底解散了，出身於根的佐井成為了木葉暗部的隊長，加上井野的山中一族一直都是木葉情報部的重要構成，所以當鳴人成為七代火影時，佐井已經統領木葉情報部門，和鹿丸一樣身為火影的左膀右臂。唯一的遺憾是，他和井野的孩子，山中井陣——竟然不穿露臍裝！！！