柳生宗茂，16歲的殺人劍劍聖，活人劍大劍豪，百年來劍道界第一天才，現在正在被關禁閉中。
事情的起因是一面很柯學的鏡子，雖然製造者據說是陰陽師而不是柯學家，但總是很柯學就是了。
鏡子顯示柳生宗茂有成為殺人狂魔的趨勢，所以柳生宗茂被柳生劍聖給關了起來。
這很難頂，因為柳生宗茂很確定劇情已經開始暴走了。
宮野明美聯絡上了他，言明她已經準備好搶劫銀行，柯南中極為關鍵的十億元搶劫案也即將發生。
本應該是這樣的才對。
或許是覺得小灰原在柳生家生活的很好，宮野明美已經放棄了搶劫銀行，畢竟作為組織的底層人員，生活和一般人其實差別不大，如果不是為了和組織交易，想讓小灰原脫離組織，那麼宮野明美也不至於玩這麼大。
可這樣一來，柳生宗茂就開始急了。
宮野明美的想當然大腦很直接，她知道自己一但放了組織的鴿子會是個什麼下場，但既然灰原已經找到了自己的歸宿（霧），那麼她自然覺得自己了無牽掛，就算就這樣死去也並無不可。
雖然柳生宗茂再三強調他能夠救下宮野明美，並且灰原也希望宮野明美活著，但宮野明美並沒有相信他。
在宮野明美看來，柳生宗茂收留灰原已經是極度危險，她不能因為自己的原因而造成灰原暴露的危險性加大。
交涉無果的情況下，宮野明美失蹤了，連同著她之前召集起來，準備一起作案的同伴們。
柳生宗茂知道，要出事了。
宮野明美失蹤的訊息被柳生宗茂暫時隱瞞了下來，只有吉川廣美和北條若三兩個人知道這個訊息，可目前來說，柳生宗茂被關了緊閉，北條若三被柳生劍聖留在了身邊，吉川廣美倒是可以自由行動，但柳生宗茂卻不願意讓吉川廣美身犯險境，哪怕吉川廣美真的很強。
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猶豫之下，柳生宗茂撥通了小柯南的電話。
“喂~這裡是毛利家。”
“別賣萌了，是我。”
“柳生，你這傢伙！”電話另一頭的柯南臉色變的很難看，他也是有自尊的，雖然他的自尊已經在小蘭給他洗澡的時候崩壞，但這並不代表著他在私底下面對柳生宗茂的時候也會裝作小孩子，更別說是賣萌的時候被抓個先行。
“為什麼要打小五郎叔叔家的電話？難道你有事找蘭？”柯南警惕的問道，雖說柳生宗茂有女朋友，但只要帥哥，就不得不防，如果柳生宗茂真的是來找小蘭的，那麼柯南一定會當場掛掉電話。
“不，我就是找你的，有特殊的情報，你要不要？”
“特殊的情報？你是說！”
小柯南一下子激動了起來，差點碰掉了面前的水杯。
“有疑似組織的人員計劃搶劫銀行，但卻在今天失蹤，主犯名為廣田雅美，家住XX町XX番地，其餘情報不明，這是一項對毛利偵探事務所提出的正式委託，委託人……目暮十三。”
……
“……所以說為什麼在哪都能見到你啊？”宮野明美暫時的住所中，目暮警官一臉嫌棄的看著毛利小五郎說道。
“啊？你在說什麼呀警部，不是你向我的偵探事務所提出的委託嗎？”毛利小五郎愣了下，同時奇怪的問道。
“嗯？這……”目暮警官剛想說自己並沒有提出過什麼委託，而就在這時，白鳥警官走了過來。
“不好意思，毛利先生，我能和目暮警官單獨說幾句話嗎？”白鳥微笑著說道。
“哦，好。”
雖然很奇怪目暮警官的反應，但既然兩個警部之間有話要說，那麼他自然沒有什麼打斷的理由。
“目暮警官，這是柳生君的請求，為了破案效率，特意以目暮警官你的名義委託了毛利先生幫忙破案，並且已經將委託費用付清，希望目暮警官能夠裝作是你提出的委託，拜託了。以上就是柳生君的原話。”
“嗯……哦，既然柳生老弟這麼說的話……”
柳生宗茂幫了他很多忙，讓他的業績很好看，並且能夠讓犯人繩之以法，所以柳生宗茂這已經明顯侵犯目暮警官權益的舉動能夠讓目暮警官接受。
但目暮警官點了點頭之後，忽然想到了些什麼，問道：“白鳥君，向我們報案說這裡有人失蹤的匿名人士不會也是……”
“……大概是的吧。”白鳥警官有些不確定的說道。
“那他為什麼自己不來？”
目暮警官有些奇怪，在他看來柳生宗茂的能力應該是超過，或者說至少不弱於毛利小五郎的，而既然柳生宗茂這麼在意這起案件，那麼自己親自出馬的話不是更好嗎？
“這個，我和柳生君通電話的時候也問了，據我的瞭解……”說到一半，白鳥警官差點笑出聲，然後強做嚴肅的說道：“據說柳生君現在正在被柳生劍聖關禁閉，不準他出家門。”
“噗嗤。”
白鳥警官和目暮警官朝著不小心笑出聲的柯南看了一眼，有些奇怪為什麼柯南會笑，隨後又反應過來了些什麼，連忙嚴厲的說道：“快把柯南帶遠一點，小孩子容易破壞現場。”
“啊，抱歉目暮警官，我這就帶柯南走！”小蘭嚇了一跳，連忙抱著柯南離開了這裡。
柯南一下子傻眼了，他算是體會到了什麼叫做樂極生悲，原本他也因為好奇為什麼柳生宗茂要以目暮警官的名義來委託，所以特意安放了一個竊聽器，可誰想到竟然聽到了柳生宗茂因為太皮被他媽關起來的訊息，這下可把柯南樂的，覺得抓到了柳生宗茂的把柄，以後可以藉此威脅柳生宗茂不要揉他的腦袋，可誰想到才高興沒多久，就被趕了出來。
‘開什麼玩笑，我要查案的呀，那個大叔能幹什麼，沒我的話他什麼也做不了！’
雖然很難受，但為了完成委託，小柯南還是想辦法又悄悄的回到了宮野明美的暫時居所，不止是為了幫助柳生宗茂查案，也是為了找到這疑似酒廠人員的失蹤者。