關於東林六君子案朱由檢的想法是坐實其貪墨的事實，同時承認魏忠賢等人當年確實對其有迫害和政治報復的事實。許顯純案的情況還是這差不多，說白了就是要將當年事定義為狗咬狗一嘴毛，不管是閹黨還是東林黨都不是啥好東西，誰也別說誰是正義的，全掃到歷史的垃圾堆裡。
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將這兩股勢力都打成臭狗屎，大明才能沿著新的方向重新出發！要不是有這兩堆臭狗屎攪合，大明何至於像前幾年那樣糜爛？總不能說是英明正確的皇帝犯了錯吧？不管是從歷史事實還是自身利益來說，都必須有人來為之前數十年的混亂背鍋，閹黨和東林黨人的黨爭在朱由檢看來就是最合適的物件。
陳演帶著人南下了，官司能打成什麼樣子？朱由檢還真沒怎麼放在心上，已經板上釘釘的事，何必再多費心力哪？
崇禎22年農曆八月、公元1649年秋，沉寂了半年之久的遼東戰事又起，大明在與滿清開啟和談的同時兵分兩路從遼陽、大稜河堡方向向瀋陽方向急攻。
邊談邊打、邊打邊談這招當年的皇太極玩的很溜，而這一次明軍同樣用的很老辣。
就在遼東戰事驟起的同時，江南的松江府關於東林舊案的審理工作正在進行，大海上數艘鄭家的海船在海軍艦船的監視和引導下楊帆向北而來。從這個八月開始，原本喜歡玩單線操作的朱由檢不得不開啟多執行緒操作。
此前的朱由檢一直有一個原則，無論局勢有多紛亂，一段時間裡的工作重心只有一個，但事情發展到現在這個態勢，再用這種思維來解決問題似乎是有點太不合時宜。
“光復瀋陽的戰事正在進行、鄭家那邊的談判也快要展開了。今日將諸位軍政要員召集來，主要是說說接下來半年要做的事。首先說政事上的，趕在年底之前大明諮巡堂要正式成立，新復的地方不少，官制、民制推行的情況到底如何，各地官員是否像京城和北直這邊的官員一樣盡心履職，朕心裡很是沒數。諮巡堂成立後，主要官員首先要幹的事是代表朕和朝廷分巡山東、雲中、遼東、以及松江、寧波等省府。太師等人要在諮巡堂任職，內閣學士和六部就有了空額。朕得想法是由吳學士任內閣首輔、兼禮部尚書，順天府尹宋應升任內閣次輔兼戶部尚書，山東的馬士英到了年底任職也滿兩年了，其在地方上的堪歷甚多，入中樞也是時候了，擢升其入閣為殿直學士、兼工部尚書。剩下的幾位閣臣和六部缺員廷推補入！”
中樞大換血的事已經在朝堂上發酵了好長時間，也是時候拍板定調了。吳甡、宋應升和馬士英入閣執政，基本上就能奠定從地方官員選官入中樞的基調。吳甡此前在山西做過巡撫，入閣以後又以閣臣的身份兼任了幾年北直總督，當內閣首輔名正言順。按說宋應升的資歷有點淺，又是非進士出身，可架不住皇帝喜歡和首肯、人家的政績也是有目共睹，由宋應升開創個舉人入閣的先河正當其時！
皇帝將最大的幾個桃子給摘了，剩下的幾個桃子周延儒們下去後得好好琢磨和分割，內閣調整的事就議到了這裡，沒啥繼續討論的餘地。
“都督府和軍令堂這邊也要適度的進行調整，諮巡堂不只是諮政、巡政的部門，在軍事、國防上亦有參諮監管巡斷之責，固需要在軍事方面有專才老成持重之人入堂。見恆久在軍機、對軍事頗熟，這些年既在地方上負責過軍事、又在兵部掌過廟算、還帶過大軍，是最為妥當的人選。入諮巡堂統領國朝軍事方面的諮巡事宜最為合適，年底之前入職，其兵部尚書和後軍都督府都督的職位由劉元斌接任。另外、馬科、唐通、等人也需調入諮巡堂以充實諮巡堂的軍事人員。”
軍事方面，現在調整的餘地比較小，就是將陳新甲等人打發著退居二線，調劉元斌進軍事決策層即可。劉元斌的軍銜已經足夠高了，在目前的大明軍隊中的地位也是獨一無二，讓他入決策層是為了向底下將領們傳達一個訊號，將領的前途不光在於帶兵作戰，合適的時候入朝堂也是份內之事。
“在軍事上，朕再多說幾句具體事宜。等瀋陽之戰結束以後，下半年對外的軍事行動主要集中在海路上。不管與鄭家的談判進展如何，福州、廈門在年末到明年年初之時必須要回到朝廷治下。若是與鄭家的談判順利，戰略可以更激進一些，透過海路將廣州城奪回來也無不可。至於陸軍方面，今年後半年到明年中段，則以擴軍實兵為主，到明年年中，朝廷的可戰之兵需要再擴二十萬左右，從而形成平定天下之勢。”
稍微緩了口氣後，朱由檢繼續就軍事方面的設想展開說道：“有鑑於今後的戰事規模將繼續擴大，朕決定在現有的軍級編制上再設一個常規編制，叫集團軍。一個集團軍由一個主戰軍、一個炮兵旅、一個輜重旅、一個騎兵旅、一個工勤旅，五個保安輔助旅組成，總兵力在五萬左右。這樣的構成差不多就具備在任何情況下獨立承擔軍事任務的能力，是正經的大戰兵團，國之倚重。除了這個正式編制外，往後會根據戰事需要將集團軍、獨立軍、獨立師、以及臨時調入戰場的保安旅合編為方面軍，進行平天下的大戰，都督府的各位也要做好準備，必要時需擔任方面軍的司令，赴戰區領大軍作戰。”
一口氣統領過十萬的兵馬，這樣的軍事存在饒是朱由檢膽子大也不敢將其軍事主官定為常設官，只能用中樞的將領充當臨時統帥，等戰事一完趕緊調其回中樞。這樣的機構，肯定也不能長時間存在，必須要做好隨時能拆分的準備。常設軍事機構到了集團軍這個規模就已經大的嚇人了，可不能再往大里擴。甚至集團軍的數量，朱由檢都不準備多設，有六七個這樣的重兵集團，應該是差不多！