貞觀九年，潤，四月，中。
赤水源之戰，薛萬均、薛萬徹率輕騎兵先行，被吐谷渾包皮圍，兄弟二人均中槍，跌下馬後徒步參戰，隨從騎兵死傷十之六七。
左領軍將軍契何力率數百騎兵前往救援，拚力廝殺進擊，所向披靡，薛萬均、薛萬徹於是得免一死。
李大亮在蜀渾山打敗吐谷渾軍，俘獲其著名首領二十人。
將軍執失思力在居茹川大敗吐谷渾軍。李靖率領各路軍馬途經積石山河源，到達且末，直抵其西部邊境。
聽說伏允在突倫川，將要逃奔到於闐，契何力想要乘勢追擊，薛萬均以先前的失敗為教訓，堅持說不行。
何力言：“吐谷渾與無定所，又無城郭，隨水草遷移流動，如果不趁他們聚居在一起時襲擊他們，等到他們四處遊蕩，如何才能能搗毀他們的巢穴？”
於是親自挑選驍勇騎兵一千多人，直逼進突倫川，萬均率部隨後。
沙漠中缺水，將士們抽飲馬血。
唐軍隊攻破伏允牙帳，殺掉幾千名吐谷渾兵，獲牲畜二十多萬，伏允隻身脫逃，唐軍俘獲其妻子兒女，侯君集等穿越星宿川，到了柏海，重與李靖的部隊會師。
大寧王慕容順，乃是隋煬帝的外甥，伏允的嫡生子，當初隋朝侍奉楊廣，很長時間不能回吐谷渾，伏允只能立另一個兒子為太子。
慕容順回到吐谷渾後，常常悶悶不樂。正趕上李靖攻破他的國家，國人愁楚不安，都怨恨天柱王；慕容順便順應民心，滅掉天柱王，舉國請求投誠。
伏允率一千多騎兵逃到沙漠中，十多天的時間，餘眾散逃殆盡，伏允被身邊人殺死。
吐谷渾人擁立慕容順為可汗。
十八日，李靖上奏說已平吐谷渾。
二十一日，太宗下詔恢復吐渾國。
任命慕容順為西平郡王、故呂烏甘豆可汗。李世民考慮到他不能降服其民眾，仍令李大亮率精兵數千人為其後援力量。
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六月，二十五日，因李世民已經為太上皇守孝三月，群臣再次請求太宗上朝聽政，皇帝應允，但瑣細事務仍委託太子處理，太子頗能裁斷政務。
此後太宗每次出外巡幸，便令太子留守監國。
這段時間李承乾的表現眾人都看在眼裡，對於陛下如此安排眾人並無多大意見。
秋，七月，鹽澤道行軍副總管劉德敏擊叛羌，破之。
二十四日，李世民下詔：“太上皇的陵墓依照漢高祖長陵的規模，務存隆厚之意。”
建陵的期限太緊迫，不能如期完成。秘書監虞世南上奏疏認為：“聖人薄葬其親屬，並非是不孝，而是深思熟慮，因為厚葬適足以成為親人的拖累，所以聖人不為。
言說過去漢朝張釋之曾說過：‘在陵墓中藏有金玉，即使鑄銅鐵封住南山還是有空隙。’
劉向說：‘死者沒有生命的極限而國家有興廢，張釋之所講的，是長遠打算。’
他們講得深刻，的確合乎道理。陛下聖德超過唐堯、虞舜二帝，而厚葬親人卻效法秦漢的帝王，臣認為陛下不當如此。
雖然不再藏金埋玉，後代之人一見丘壟如此高大，怎麼知道沒有金玉呢？而且如今陛下服喪依照漢文帝，三十七天脫下喪服，但是丘壟制度惟獨依照漢高祖的長陵，恐怕不大合適。
希望陛下能夠依照《白虎通義》一書，為太上皇建造三仞高的陵墓，所用器物制度，一律節省簡化，將這些刻石碑立於陵旁，此外另書寫一通，藏在宗廟內，用做後代子孫永久效法。”
上疏奏上後，虞世南久久沒有得到回覆。
虞世南再次上疏，認為：“漢代帝王即位後即營造山陵，有的營建時間達五十多年；如今幾個月之內要得到幾十年的功效，恐怕人力難以做得到。”
李世民這才將虞世南的奏疏傳給有關部門，讓他們詳悉商討處理。
房玄齡等人議論認為：“漢高祖長陵高達九丈，漢光武帝原陵高六丈，而今九丈則太高，三仞又太低，請求依照原陵六丈的規模。”
皇帝欣然應允。
十八日，皇帝下詔：“建國之初一切制度都是草創階段，宗廟制度不完備，如今要將太上皇的神主遷入宗廟，應當讓禮儀官們詳加議處。”
諫議大夫朱子奢請求立三昭三穆而空下始祖之神位。
於是增修太廟，增入遠祖弘農府君重耳和高祖神主與原有的宣簡公、懿王、景皇帝、元皇帝四神主，共為六室。房玄齡等人議論以涼武昭王李為始祖。
左庶子于志寧議論認為王業並非從李直接繼承，不能做為始祖，太宗聽從其意見。
當月，党項寇疊州。
李靖在進攻吐谷渾時，曾用厚禮賄賂党項，使他們做嚮導。
党項首領拓跋赤辭來到軍中，對眾位將領說道：“隋朝人不講信用，總是劫掠我們。如今你們的各路兵馬如沒有害我之意，我請求供給你們糧草；如若不然，我們將要佔據險要之地以阻塞你們前進。”
眾位將領與他訂盟並放他回去。
赤水道行軍總管李道彥行軍到了闊水，見拓跋赤辭沒有防備，便偷襲他，獲幾千頭牛羊。
於是惹怒了羌族人，他們佔據野狐峽，使李道彥的部隊不能前進。拓跋赤辭襲擊並打敗李道彥，死數萬人，李道彥部撤退到松州。
左驍衛將軍樊興因逗留而耽誤軍期，士兵們多逃亡丟失。
二十二日，李道彥、樊興均因此獲罪，被免於死刑流放邊地。
皇帝派使節在大鬥拔谷慰勞眾位將領，薛萬均抵毀契何力，誇耀自己的功勞。
何力非常氣憤，拔刀而起，想要殺掉薛萬均，眾將救下薛萬均並制止了何力。
李世民聽到此事後，責問契何力，何力說明詳細的情況，太宗勃然大怒，想要解除薛萬均的官職以授給何力，何力執意推辭，說：“陛下由於我的緣故而解除薛萬均官職，那些胡族官員不知詳情，還以為陛下重視胡族而輕視漢人，以訛傳訛，爭鬥之事必然多起來。而且使胡族認為將領們都如薛萬均。將有輕視漢人之意。”
李世民聽從其言，並沒有處置薛萬均。
不久，命令契何力為玄武門宿衛官，檢校屯營。又將宗室女臨洮縣主嫁給他。