“帝皇暫時的離去，令帝國上下都陷入到悲痛之中，但帝國仍要向前邁步，在基因原體的帶領下，帝國必然會更加興盛，進而攻破思維空間，解救為人類而犧牲自我的帝皇！”
————《帝國大叛亂後記》
令帝國元氣大傷的大叛亂，終於在基因原體的親自帶領鎮壓，與數百個戰團、無數軍團艦隊協力的鎮壓之下，得到了徹底的覆滅。
天堂大軍與天使軍隊被帝國血腥領主軍團，死亡守衛軍團與銀月蒼狼軍團以及近百個戰團聯手覆滅，強大的猩紅之主與死亡守衛之主親自斬殺了兩個神聖天使長。
狼王用帝皇賦予的狼王之爪重傷了兩名天使長，在兩名天使長的胸膛處留下了六道永遠不可能恢復的爪傷。
在驅逐墮落戰士、叛亂軍團與惡魔大軍的時候，大混亂者格雷克斯被獅王一劍斬首並永遠覆滅，其所附帶的混亂概念也被帝皇賦予的神聖武器徹底泯滅。
當神聖的獅王揮起帝皇為他打造的巨劍，斬殺惡魔大混亂者格雷克斯的頭顱泯滅他的概念時，被混亂大魔的概念所侵擾的戰場陷入到無休無止的癲狂，混亂的帝國軍隊也得到了解放。
當大墮落者芬里斯打算逃跑時，一直隱藏在暗處神秘的教皇突然現身，他就像一顆從天而降的璀璨流星一樣，瞬間以強絕的攻擊貫穿了大墮落者的胸膛，並將其靈魂抽出，用神聖的帝皇聖炎焚燒他的靈魂，泯滅了它所在的概念。
無論是天使、惡魔還是人類帝國，在這場大叛亂中都不是最終的贏家，紛紛元氣大傷。
天堂中神聖的天使長，天使位列的頂端被滅殺了兩位，惡魔在這場大叛亂中總計隕落了四頭大魔，人類帝國損失了大量的戰團，有的戰團的編制已經被徹底泯滅，並且還滋生了源源不斷的叛亂勢力與殺不盡的惡魔餘孽。
夥同眾神一同進攻人類帝國的異形種族也在緩過氣來的帝國軍隊、帝國海軍、帝國陸軍、帝國各個戰團與軍團的攜手打擊下銷聲匿跡，遭受重創，甚至有近30多個種族被永久滅絕，他們所在的母星也被帝國實施滅絕令，徹底燒成了玻璃化的星球。
人類帝國最終再次取得了勝利，天堂勢力重新縮回了他們的光洞之中，在惡魔之淵，帝國重新啟動了由帝皇親自加持的黑石閣樓體系，無數隱秘的維度空間鎖鏈再次將這個神秘扭曲、充斥罪孽的黑洞所封鎖。
潰逃的墮落軍團，墮落神之兵器、墮落戰士與惡魔躲入了惡魔之淵中，經過這一次的大叛亂，帝國海軍派遣了規模足足達到20萬的鎮守艦隊，配合十六支戰團重新佈置更加強烈的封鎖線。
在滅絕種族的矮矮屍骨之上，在天使舔舐傷口與惡魔的哀嚎之上，人類帝國再次捍衛了自己的尊嚴，並徹底奠定了自己的霸主地位。
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基因原體雖然沒有傷亡，但是偉大的帝皇與天堂三神，七宗罪邪神共同陷落在四維空間深處的餐桌之上，帝皇與眾神一同彼此牽制在空間的最深處，無法與帝國取得有效聯絡。
雖然元氣大傷，但在帝國龐大的體量與近千萬顆殖民星球的共同加持下，帝國的生氣正在快速恢復，帝國各個部門重新運轉，11名基因原體配合帝國攝政王著手開始恢復帝國慘遭摧殘的經濟體系、政治體系、社會體系、軍事體系。
在這場大叛亂中，帝國近乎有1/3的疆域陷入到了混亂與哀嚎中，這都是現在他們要處理的難題。
實際上，現在攝政王與基因原體所面臨的最大的困境，則來自於失去帝皇后帝國內部不斷掀起的恐慌與動盪。
社會體系的崩塌可以重新搭建，經濟上的損失可以慢慢的生產恢復，軍事方面的崩潰也可以重新制定更嚴密的制度來進行更合理的規劃，並防範於未然，帝國子民所遭受的損失可以由帝國的中央政府進行補貼和安撫。
但帝皇的消失，尤其是帝皇現身並與眾神共同進入到那片神秘詭譎的超自然空間並杳無音信後，帝國內部無論是帝國子民、帝國官員、帝國高層、帝國軍官等等各個方面、各個階級的人都開始恐慌了起來。
因為所有人都知道，帝國真正的底蘊，領航者與科技的推進者帝皇卻失去了蹤跡，雖然帝皇與眾神的消失僅僅在幾分鐘之內便已經解決了戰鬥，但是在他們恐怖的異象催生下，仍然有大量的帝國子民見證了這一幕，並且這些訊息以風一般的速度開始朝著帝國各個方向進行傳播，整個帝國再度陷入到恐慌之中。
甚至在大叛亂時期，恐怖的惡魔浪潮，那些背叛帝國的超人類戰士墮落到惡魔懷抱，或者天使蠱惑中的叛亂軍團被蠱惑，被操縱的帝國神之兵器行走在一顆又一顆的星球上時，帝國的整體輿論與帝國子民都沒有這般恐慌過。
帝皇不僅僅是人類帝國的領導者，人類經濟、文化、軍事、政治、社會的絕對統一領導者，更是人類科技的開闢者與科技樹的培育者。
在人類最困難的那些歲月中，一直都是帝皇與他的神之子嗣領導著人類度過了絕望的寒冬，進一步引導人類成為這宇宙之間的絕對霸主。
帝皇的概念已經超脫了自身所擁有的概念，進而成為了人類心中的絕對之主，人類之主，人類概念的附加者，信仰概念的絕對踐行者與帝國的守護者。
無論何時何地，無論面對多麼困難的境地，無論遭受到多麼殘酷的對待，帝國子民、帝國士兵們以及那些超人類戰士們永遠堅信，帝皇正在帝國的至高皇宮之中，坐在自己的皇座之上，用慈愛的目光注視著他們。
可現在帝皇透過犧牲自己作為代價帶走了四維空間中的眾神，是人類再也不用面臨超規格力量的降臨，為人類的發展迎來了寶貴的時間。
無論怎麼說，帝皇的消失也讓人類失去了心中最堅固的那根擎天巨柱，帝國的領導者消失了，科技前沿的開闢者消失了，人類的守護神消失了，人類的信仰與人類自身概念的寄託者消失了。
這也讓帝國陷入到了前所未有的恐慌之中，因為帝國的上上下下都知道，帝皇不會是像當年的百年消失那樣還會再度露面，反倒是徹底的近乎永遠的消失在了人類帝國。
就算是帝國攝政王透過各種方式來安撫百姓，就算是基因原體駕馭著自己的戰艦，領導著自己手下的軍團不斷的遊走於帝國星域，就算是帝國長公主費盡唇舌去安撫那些帝國的子民也無濟於事。
國教現在就像是發瘋了一樣，派遣出了大量的牧師、執事，紅衣主教、普通主教、星域大主教，甚至教皇也時不時的現身在帝國的各個星域，他們宣揚著帝皇是去消滅眾神，帝皇慈愛且神聖的目光永遠注視著人類，不要害怕，這只是帝皇賦予給他們的考驗。
接下來恐怕也只能用時間來撫平恐慌，用自身真正的行動來昭告所有的帝國子民，昭告整個人類，人類必須自立自強，他們也有能力守護帝國，帝皇也一直在注視著他們。