放學之後，柯南選擇回毛利偵探事務所，他最近發現小蘭有點問題，不是戀愛了，而是……神出鬼沒，不知道她去做了什麼。
沒有加入主神空間成為輪迴者之前，柯南就對小蘭特別的關注, 生怕她移情別戀，當她發現小蘭跟園子出去約會的時候，也會想方設法的跟著小蘭一塊去，如果有人對小蘭有想法，他就會去搗亂，反正就是不讓小蘭移情別戀。
最近小蘭表現的相當神秘, 也不知道她在忙活什麼，柯南有點小擔心, 打算去跟蹤小蘭。
但想到了他那蹩腳的跟蹤技術……柯南就沒有信心了，上上次在多羅碧加遊樂園跟蹤，結果變成了小學生，上次在街上跟蹤怪人，結果加入了主神空間。
基本上每次跟蹤都不會有好事。
這次呢？
萬一他這次跟蹤搞砸了，那就糟糕的不能再糟糕了，說不定會真的掛掉。
但他能不去跟蹤小蘭嗎？
這是絕對不可能的，為了小蘭，為了他自己，該跟蹤的時候，還是要挺身而出去跟蹤的。
不過，當柯南來到了鞋櫃，剛換好了鞋，就被熊孩子們給攔了下來，說是有什麼委託，需要他來幫忙。
這個委託, 就是給他們少年偵探團的委託。
原本他剛來到帝丹小學，立馬就有光彥、元太和步美跳出來當他的好朋友。
為此搞出來一個少年偵探團的小團體。
人也不多, 就三個熊孩子, 外加上一個柯南。
小孩子在一塊胡鬧，沒有大人會重視的，只是一個少年偵探團而已，更不算什麼。
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後來，柯南帶著三個熊孩子屢破奇桉，漸漸地聲名鵲起，少年偵探團也就落實了，從一個陪熊孩子們玩的自娛自樂的小組織，變成了一個正規的小團體。
“柯南，我們接到委託了，是隔壁班的同學的哥哥不見了，拜託我們來尋找他。”
步美甜甜的對柯南說道。
“來幫忙吧柯南，我們少年偵探團需要你。”
元太握緊了小拳頭，像是在威脅柯南一樣的請求道。
“就是啊柯南，你要是來的話，灰原同學也會一塊來的，我們想讓灰原同學也加入我們少年偵探團。”
光彥充滿了期待的目光看著柯南說道。
自從灰原哀過來之後, 光彥就移情別戀了, 原本還喜歡步美，甚至為了步美跟元太爭風吃醋, 現在眼睛裡全都是灰原哀。
這個可愛又迷人的小姑娘，在小學生們之中還是蠻受歡迎的。
“你們都這麼說了，我還能拒絕你們不成。”
柯南相當的無奈，最後答應了熊孩子們的請求，陪他們一塊去玩，為此還帶上了灰原哀。
在陪同熊孩子們調查的過程之中，柯南漸漸地發現了問題所在——這個找他們幫忙的小朋友說對了，他的哥哥還真是被人給綁架了。
而他提到的他哥哥遇到了一個一身黑的女人，這讓柯南聯想到了害他變成小學生的那兩個人。
該不會這麼巧吧？
柯南心動了，想要找到那個黑衣女人，看看他到底是不是害他變成小學生的那個組織的人。
灰原哀倒是很清楚，組織裡絕對沒有一個那樣的黑衣女人，這跟組織沒有關係，是意外。
當柯南帶著熊孩子費了好大一番功夫，最後調查出了這是一夥偽鈔集團，還找到了她們的據點，就在某個警察局的隔壁。
這還真是藝高人膽大啊，燈下黑的原理，運用的也蠻熟練的。
“我一個人上去看看，你們在這裡等著，如果我半個小時之後沒有下來，你們就去報警。”
柯南丟下了熊孩子們，準備一個人上去。
他不是小學生，而是高中生，還加入了主神空間成為輪迴者，變成了寵物小精靈訓練師。
雖然就一個寵物小精靈球，裝了一隻皮卡丘，但在這個世界裡，他的皮卡丘應該很厲害……吧？
柯南也不敢肯定，但他認為自保有餘。
當柯南上去十多分鍾之後，熊孩子們也上去了，她們本來就不聽柯南的話，認為柯南上去是出風頭。
熊孩子們嘛，想的不是太多，一出是一出。
她們上樓之後，發現了偽鈔集團的秘密，然後就被抓了起來，要被處決掉……
柯南隱藏在暗中，也看到了這一幕，但卻不為所動。
在他看來，讓熊孩子們吃個教訓，也是理所當然的，最起碼不能總是被坑。
所謂吃一塹長一智，這也是有道理的。
在最後時刻，柯南挺身而出，利用他召喚出來的皮卡丘，一個接著一個的收拾掉了偽鈔集團。
最後還想著逼問偽鈔集團的老大，讓她坦白從寬，抗拒從嚴。
結果她什麼都交代了，就是沒有害他變成小學生的那兩個人的詳細情報……
“算了，不是就不是吧，鬧了個烏龍啊。”
柯南無所謂的搖了搖頭，並沒有太過放在心上，但最後報警了，目暮警官過來，先是教訓了她們幾個熊孩子一頓，然後就派人把步美她們三個熊孩子給送走了，剩下的灰原哀，卻讓柯南給送回去。
柯南不太明白，連步美她們三個都送走了，為什麼不送她們兩個呢？
哦，你說距離家近，這倒是個好藉口。
柯南翻了翻白眼，帶上了哭泣中的灰原哀，向她所謂的家走去。
之所以灰原哀會哭，還不是在偽裝啊。
就跟原作劇情一樣，這是灰原哀對柯南的考驗，也是她的所謂惡趣味。
“好了，灰原同學，目暮警官都向你道歉了，他是個老好人，不是故意嚇唬你的。”
柯南當上了護花使者，護送灰原哀回家，卻忍不住說道：“你哭了這麼長時間，也該哭夠了，那麼請你不要再哭了。”
灰原哀本來就沒有哭，只是在乾嚎罷了，她抬頭看向柯南，神情嚴肅的說道：“APTX-4869，你知道這是什麼嗎？”
“灰原同學，不要在這裡說些亂七八糟的東西。”
柯南摸了摸灰原哀的小腦袋，只覺得她挺好笑的，突然來了這麼一句古怪的問話，她的心裡到底在想些什麼。