在鯤鵬基地的陸戰一師官兵們歡慶的時刻，遠在拉包爾的日軍基地中卻是籠罩在一片沮喪的死灰色氣氛中。
在這起被稱為“海軍甲事件”的長官座機遇襲事故中，山本司令官和宇桓參謀長身亡，現在聯合艦隊司令部徹底處於群龍無的混亂狀態。
在這種情況下，海軍軍令部決定緊急任命佐世保鎮守府司南雲忠一中將擔任聯合艦隊代理長官職位。
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其實連南雲自己也知道，現在之所以讓自己出任代理長官，先是因為現在的聯合艦隊是一塊又燙又爛的泥巴，第二是軍令部派系在司令官繼任人選上意見相左，爭執不下的情況下才決定由南雲第36期海軍兵學校畢業生出任。
“大概是那些長官老爺們認為我資歷淺，隨時都可以被換下吧。”雖然相比較古賀峰一、豐田副武這些海軍兵學校34期的前輩而言，南雲自認為是個“後輩”，但是自己被當作“後備”輪胎一樣來使用，無論如何心情是不愉快的。
更不愉快的，是每天傳來的壞消息。
搜尋部隊已經找到了山本座機的殘骸以及司令官本人的屍體。根據唯一生還的零戰飛行員笠原忍陳述，前來襲擊的確實是掛著晴天白日標誌的中國戰機。
中國戰機出現在南太平洋上空已經是件很不可思議的事情了，而且還擊落了聯合艦隊司令長官的座機。
更不可思議的是，中**隊在奇襲後的第二天就大肆宣傳，並向媒體展示了長官的遺體照片。
這在部隊裡掀起一場軒然大波。
南雲先是懷疑搜尋部隊的人將長官遺體照片出賣給了敵人。
日軍內部的肅奸審訊迅進行得如火如荼，至少四名被重懷疑的搜尋聯隊成員被打成半身不遂。
直到這時，情報部門才姍姍來遲的確認，中**隊方面公佈的照片是偽造的。
儘管照片是假的，被打殘的士兵是清白的，南雲卻有種啞巴吃黃連的感覺——因為山本大將確實死了，他沒有辦法讓山本借屍還魂出來澄清中國人玩的詭計。
做事踏踏實實的南雲忠一中將只能老老實實地向軍令部彙報：他已經做了全部的努力，但是似乎看起來沒有辦法阻止山本大將戰死的訊息在士兵當中流傳。
6月8日，日本海軍部對外正式宣佈：
“傑出的帝國提督，聯合艦隊司令官山本五十六海軍大將於5月26日在赴前線視察途中遭受不明戰機襲擊而壯烈殉國，特追贈山本五十六帝國海軍元帥軍銜。”
可以想象，這條訊息的宣佈對廣大日軍的士氣有著如何沉重的打擊。
事實上，作為日本海軍的靈魂人物，山本五十六是在日本民眾心目中的地位僅次於天皇和東條相的第三神人。
從東京到大阪，從神戶到長崎，悲傷的陰霾籠罩了天空。數以萬計的日本市民們頭系白布，自走上街頭為戰死異鄉的帝國海軍第一軍人送葬。
山本的死訊也使得更多人覺得太平洋戰爭形勢猶如垂暮的夕陽一般無可挽回，於是愈沮喪，只能依靠著鴉片的麻醉來麻痺神經。根據蝴蝶效應，出現在李鴻紅木公司帳面上的收益又比平時增加了兩成。
南雲忠一中將在公佈了山本五十六的死訊後，另一個迫切需要解決的問題是密碼問題。
中**方堂而皇之地宣佈中方破解了日軍絕密密碼，才取得了擊斃山本大將的戰果。
對這種法，海軍部的情報專家們予以了強烈的駁斥。專家們的觀是，海軍密碼絕對不可能被破譯，更不可能被支那軍隊破譯。
負責情報工作的海軍省次官澤本賴雄中將甚至對天誓，如果真的是支那軍人破譯了海軍密碼，他將剖腹自殺三次。
澤本賴雄中將用一種不屑一顧的語氣強調：“支那軍絕不可能破譯紫色密碼，退一萬步講，即便支那人破譯了紫碼，也絕不會愚蠢到對外公佈的地步。支那軍這樣堂皇地公佈破譯了紫碼，其目的正是為了掩蓋獲得情報的真實渠道，也恰恰明了紫碼是安全的！”
事實上，由於自甲午海戰後屢戰屢勝，日本海軍的自信心空前膨脹，保密觀也相當之差。唐甬記得，將要出征的海軍軍官三杯酒下肚，就拉著身邊的陪酒歌伎杏子春子之流掏心窩子。
中途島作戰前夕，吳軍港所有居酒屋的媽媽桑們幾乎沒有不知道聯合艦隊要去一個什麼叫“中途島”的地方的。好像是怕情報洩露的不夠徹底，中途島攻略部隊還用平文出過一封“某月某日以後請將郵件轉到中途島”的電報。
在這種背景基調下，海軍部逐漸把矛頭指向了內部。
南雲忠一下令憲兵部和特高課協同工作，對所有涉及山本行程電文的軍官進行嚴格的審查。按照特高課的一貫風格，審查很快走火升級，過3o名佐級軍官被刑訊審問，其中嫌疑最大的九名軍官遭受了來自同僚的非人酷刑逼供。
憲兵部和特高課日以繼夜地嚴刑折磨這九名可憐的日本軍官，希望早日拿到需要的口供。
以澤本賴雄中將為的海軍情報部門也翹以盼審訊能早出結果以洗刷恥辱。
當然，代理司令官南雲本人也盼望早抓出奸細，一了百了。
在這樣一種呼之欲出的氣氛中，酷刑逼供進行的如火如荼，第二次打斷腿骨後挺刑不過，不負眾望地招認自己在酒醉後失言吐露了山本大將的行程。
奸細落網是海軍部、憲兵部和特高課幾方面都樂於看到的最好結局，也一舉洗脫了情報部門蒙受的屈辱。
年輕的春藤少佐作為眾矢之的被匆匆槍決了事。事實上被拖上刑場的春藤已經在多日的酷刑下遍體鱗傷氣息奄奄。對於這個可憐的替罪羊來，最後一槍了斷似乎也是個不錯的解脫。
不管怎麼樣，總算是有個交待了，南雲忠一中將指揮若定，特高課和憲兵部迅抓獲了奸細，澤本賴雄中將也不必為此而剖腹三次了。
被海軍部稱為“甲事件”的山本遇襲一案也算是落下帷幕。