1998-1999賽季對於馬刺隊來說是一個非常特別的賽季，可以說正是在這個賽季，馬刺隊完成了權利的交接，大衛羅賓遜正式退居二線，主要做好籃板以及防守工作，衝鋒陷陣則是由鄧肯披甲白蘇，銀槍跨馬。
這個過程其實並不如日後被人想得那樣津津樂道，水到渠成，事實上，當年的羅賓遜才歲，遠遠不到歸田卸甲的年紀，放下權利的大旗就意味著從此與個人名譽無緣，將來會嚴重影響自己的歷史地位，剛開始的羅賓遜並不適應，但是波波維奇和老闆霍爾特找到了羅賓遜，忽悠，忽悠，接著忽悠，加上羅賓遜這個人確實不錯，再加上鄧肯那一段時間打得確實不錯，這件事就這麼定下來了。
本賽季鄧肯場均1.7分11.4個籃板球.5次封蓋，這樣的表現讓他在當年的常規賽MVP的評選中位居第二，而羅賓遜則是場均15.8分10.0個籃板球.4次封蓋，鄧肯場均出手16.9次，羅賓遜場均出手10.8次，上個賽季報銷的艾奧利特本賽季復出場均11.分4.個籃板球和.次助攻，小將軍約翰遜場均9.7分7.4次助攻，馬刺在這個只打了50場比賽的縮水賽季裡，拿下了7勝1負，與猶他爵士並列聯盟第一。
季後賽首輪，馬刺隊的對手是新崛起的明尼蘇達森林狼，整體實力佔優的馬刺:1淘汰後者，這也是NBA進入二十世紀之後，最偉大的兩位前鋒鄧肯與加內特的第一次對決，鄧肯場均18.8分10.8個籃板球.次助攻.0次封蓋，投籃命中率46%，加內特則是場均1.8分1.0個籃板球.8次助攻.0次封蓋，投籃命中率是44.%，兩個人算是旗鼓相當，加內特彼時是森林狼攻防核心，也自然是對手頭點照顧物件，相比於鄧肯，加內特出手更多，得分更多但是命中率較差。
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馬刺隊次輪的對手也是一支剛剛重組完成的球隊，洛杉磯湖人，彼時的湖人已經擁有了奧尼爾與科比兩位基石，其他球員也都是非常不錯的角色球員，此番大戰，也是鄧肯與奧尼爾在季後賽的首次相遇！很多人都期待著這是一次針尖對麥芒的系列賽，但是四場比賽過後，馬刺以令人大跌眼鏡的4:0橫掃了湖人，馬刺也沒什麼奇兵爆發，每場比賽也都打到了最後，就是比湖人強一點點，奧尼爾四場比賽場均.8分1.0個籃板球1.8次封蓋，投籃命中率是49.%，鄧肯場均9.0分10.8個籃板球.0次封蓋，投籃命中率是5.%，鄧肯稍佔上風的原因就是大衛羅賓遜，比賽中馬刺可以用羅賓遜來防守奧尼爾，但是湖人卻找不到誰可以防住鄧肯。
西部決賽，馬刺的對手是老牌勁旅波特蘭開拓者，跟湖人一樣，四場比賽過後，馬刺再次送給開拓者一個4:0，羅賓遜場均17.5分9.0個籃板球.次封蓋，鄧肯場均16.8分9.8個籃板球.5次封蓋，這一輪系列賽的一個關鍵人物就是埃利奧特，他在第二戰中上演絕殺，比賽還剩下9秒鐘，埃利奧特面對胳膊長度絲毫不差於鄧肯的拉希德-華萊士的防守之下，身體失去平衡，踮著腳尖投中了壓哨三分，馬刺被開拓者按在地上揍了一晚上，最終一拳KO對手。
馬刺隊在……很久很久我都不記得有多久了之後，終於第一次殺進了總決賽，彼時，他們的對手是紐約尼克斯。
那一年的尼克斯堪稱神隊，他們常規賽是東部第八號種子，季後賽首輪與熱火火拼，著名的“麥迪遜花園世紀大戰”正是發生於此，范甘迪抱了莫寧大腿，拉里-約翰遜左右開弓最終把常規賽戰績第一的熱火揍出了季後賽，隨後他們又橫掃了老鷹，4:擊敗步行者，從而成為了NBA歷史上總決賽順位最低的球隊。
尼克斯這一季走來伴隨著神奇，但是他們的運氣到總決賽就消失殆盡了，“紐約之王”尤因在常規賽便有嚴重的傷病隱患，但是那時候尼克斯戰績不好，尤因咬著牙帶傷作戰，最終一路打到總決賽，尤因終於倒下了，跟腱撕裂，賽季報銷。而拉里-約翰遜的背傷發作，這也是他的老傷了，雖然強硬的大媽也是帶傷作戰，但是傷病嚴重影響了他的競技狀態，雖然尼克斯幾乎是倒下了兩元大將，但是他們還有“中投王”阿蘭-休斯頓，“狂人”斯普雷維爾，還有在NCAA與鄧肯齊名的馬庫斯-坎比。
總決賽首場比賽，鄧肯大發神威，全場1投1中轟下分16籃板助攻搶斷封蓋1失誤，替補席上的賈倫-傑克遜大爆發，上場5分鐘轟下17分，而尼克斯只有斯普雷維爾和休斯頓在苦苦支撐，並且命中率並不高，兩個人合力拿下8分卻用掉了整整41次出手，還出現了多達8次失誤，最終馬刺隊以89:77輕取尼克斯。
第二場比賽就如同是第一場比賽的翻版，不，事實是相比於首場比賽，馬刺更強，而尼克斯更弱，全場馬刺只拿到區區80分，但是尼克斯更差，他們僅僅得到67分，斯普雷維爾與休斯頓發揮正常，前者取下6分後者拿下19分，但是其他球員發揮極差，拉里約翰遜1投只有中拿下5分，馬庫斯坎比9投中拿下的6分已經是球隊第三高分了，反觀馬刺，全隊四人得分上雙鄧肯5分15籃板助攻4封蓋，羅賓遜16分11個籃板球，馬里奧-艾利得到15分，奧裡奧特拿下10分。
兩場比賽過後，馬刺取得了:0的領先，但是最重要的是比賽看起來一點波瀾都沒有，尼克斯隊被打得毫無脾氣，但是在第三場比賽，尼克斯在主場為尊嚴而戰，強硬地以89:81拿下總決賽首場勝利，阿蘭-休斯頓轟下4分，斯普雷維爾取下4分，拉里-約翰遜打出了系列賽最好的一場表現，16投6中得到16分，防守中鋒科特-托馬斯成為了奇兵，出場17分鐘搶下10個籃板球其中包括5個前場籃板球，而馬刺隊這邊內線雙塔合力拿下45分個藍把球，但是其他人發揮糟糕，得分上雙的再只有小將軍約翰遜1人（10分）。
這場勝利真的是尼克斯的強弩之末了，第五戰，尼克斯主動變陣，他重用馬庫斯-坎比，而後者也不負眾望，15投8中看下0分1個籃板球，斯普雷維爾轟下6分，阿蘭-休斯頓取下0分，但是三人得分0+的表演依舊沒能擊敗馬刺，馬刺五人得分上雙，鄧肯拿下8分18個籃板球，每到了季後賽總有發揮的馬里奧-艾利這次成為了馬刺奇兵，9投6中拿下18分6籃板4助攻搶斷，艾弗裡-約翰遜，埃利奧特，和羅賓遜各自拿下14分，馬刺96:89擊敗尼克斯。
最激烈的比賽來自於第六場比賽，斯普雷維爾天神附體，手感熱的發燙，全場比賽還剩下47秒鐘的時候，斯普雷維爾已經轟下了5分10個籃板球，馬刺隊此時以75:77落後分，此時，埃利奧特把球傳給了艾弗裡-約翰遜，小將軍三分線外一劍封喉，78:77，隨後斯普雷維爾神奇不在，三分偏筐而出，鄧肯在第五場比賽拿下1分9個籃板球馬刺4:1擊敗尼克斯登頂總冠軍，成為了第一支贏得NBA總冠軍的前ABA球隊。
五場比賽，鄧肯場均7.4分14.0個籃板球.4次助攻.次封蓋，榮膺總決賽MVP，要知道，這才是他NBA生涯的第二年而已，大衛羅賓遜場均16.6分11.8個籃板球.0次封蓋，馬里奧-艾利成為了球隊第三火力點，場均能夠砍下1.6分，艾弗裡-約翰遜場均9.分7.次助攻，埃利奧特總決賽發揮不好，場均只有8.0分.0個籃板球.0次助攻。
埃利奧特在總決賽上慘淡的發揮其實一個傷病隱患，他的腎不行了，必須進行腎臟移植手術，8月份，埃利奧特成功移植了由哥哥捐贈的腎臟，半年之後，埃利奧特由回到了賽場之上，其堅強與韌性讓人動容！
1999-000賽季，鄧肯場均.分.4個籃板球羅賓遜場均17.8分9.6個籃板球約翰遜場均11.分6.0次助攻，從邁阿密熱火挖過來的替補控衛特里-波特場均能夠拿下9.4分，重新回到賽場之上的肖恩-埃利奧，本賽季打了19場比賽，場均上場0.6分鐘，能夠拿下6.0分。馬刺隊本賽季取得了5勝9負的戰績，以西部第四殺進了季後賽，首輪對手是由賈森基德率領的菲尼克斯太陽。
就在馬刺隊準備季後賽對手的時候，球隊傳來噩耗，鄧肯在一次扣籃中傷到了手腕，賽季報銷……這些得了，別考慮季後賽對手了，還是讓季後賽對手考慮你吧，最終季後賽首輪馬刺1:被太陽淘汰出局。大衛羅賓遜場均能夠拿下.5分1.8個籃板球和.0次封蓋，但是7.%的投籃命中率證明他是真的老了。（未完待續）